More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3639 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 106 aa  209  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 104 aa  125  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  52.43 
 
 		 104 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0086  50S ribosomal protein L21  60.4 
 
 		 104 aa  114  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109341  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 103 aa  110  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  110  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  50.49 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  45.54 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  103  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  103  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 102 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1036  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0850957  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  102  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 102 aa  100  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  42.86 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 105 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  100  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  100  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  100  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  42.45 
 
 		 223 aa  100  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4877  50S ribosomal protein L21  49.06 
 
 		 130 aa  100  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 104 aa  100  9e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4414  50S ribosomal protein L21  49.06 
 
 		 130 aa  100  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 104 aa  99.4  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  99.4  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4922  50S ribosomal protein L21  47.17 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0179671  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  98.6  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 102 aa  98.6  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 102 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 102 aa  98.2  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 102 aa  98.2  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 102 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 102 aa  98.2  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 102 aa  98.2  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 102 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 102 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  97.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  42.86 
 
 		 129 aa  97.1  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  97.1  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  42.86 
 
 		 142 aa  96.7  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2704  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>