More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3612 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3612  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 
624 aa  1269    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3150  cobalamin synthesis protein P47K  47.19 
 
 
640 aa  544  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179732  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0917  cobalamin synthesis protein P47K  35.99 
 
 
614 aa  342  1e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2135  cobalamin synthesis protein P47K  31.98 
 
 
596 aa  322  9.999999999999999e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0508  cobalamin synthesis protein, P47K  33.68 
 
 
648 aa  290  4e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1617  G3E family GTPase-like protein  32.81 
 
 
625 aa  269  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000670583  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1723  cobalamin synthesis protein P47K  29.19 
 
 
615 aa  231  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2727  cobalamin synthesis protein, P47K  31.54 
 
 
298 aa  140  8.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.081954  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  31.63 
 
 
320 aa  140  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  33.44 
 
 
320 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  36.84 
 
 
379 aa  136  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  36.84 
 
 
372 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  30.15 
 
 
404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3403  cobalamin synthesis protein P47K  32.18 
 
 
341 aa  134  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  33.22 
 
 
332 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  34.5 
 
 
322 aa  132  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  38.57 
 
 
366 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2604  cobalamin synthesis protein, P47K  27.6 
 
 
296 aa  131  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2658  cobalamin synthesis protein P47K  27.6 
 
 
296 aa  131  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  32.04 
 
 
323 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  29.28 
 
 
394 aa  129  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  40 
 
 
349 aa  128  3e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4357  cobalamin synthesis protein, P47K  32.25 
 
 
419 aa  128  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  31.51 
 
 
323 aa  127  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  30.96 
 
 
323 aa  125  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  35 
 
 
339 aa  126  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  30.58 
 
 
350 aa  125  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  37.31 
 
 
379 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  32.01 
 
 
364 aa  124  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  37.7 
 
 
320 aa  124  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  36.14 
 
 
364 aa  124  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0182  cobalamin synthesis protein P47K  27.22 
 
 
308 aa  124  7e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41587  predicted protein  28.9 
 
 
339 aa  123  8e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0182638  normal  0.0311879 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  30.09 
 
 
360 aa  123  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  38.07 
 
 
460 aa  123  9e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3106  cobalamin synthesis protein P47K  36.59 
 
 
395 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2386  cobalamin synthesis protein, putative  27.09 
 
 
293 aa  123  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  38.27 
 
 
460 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  36.36 
 
 
338 aa  123  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2475  cobalamin synthesis protein, P47K  36.59 
 
 
393 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557967  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3089  cobalamin synthesis protein, P47K  36.59 
 
 
393 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356771  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  35.68 
 
 
384 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  38.5 
 
 
457 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  30.1 
 
 
323 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2998  cobalamin synthesis protein P47K  36.1 
 
 
387 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.249675 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  38.71 
 
 
354 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  36.92 
 
 
382 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  30.1 
 
 
323 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0345  cobalamin synthesis protein P47K  37.19 
 
 
362 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.593082 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  40.22 
 
 
452 aa  122  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4377  hypothetical protein  37.19 
 
 
363 aa  122  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  30.1 
 
 
323 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3135  cobalamin synthesis protein, P47K  36.1 
 
 
388 aa  122  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470512  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0193  cobalamin synthesis protein P47K  29.9 
 
 
320 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.9456  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  30.55 
 
 
375 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  36.46 
 
 
369 aa  120  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  39.66 
 
 
449 aa  120  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  36.92 
 
 
355 aa  120  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  30.23 
 
 
335 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  31.82 
 
 
341 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  38.33 
 
 
361 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  30.03 
 
 
343 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  37.78 
 
 
349 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  37 
 
 
460 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3084  cobalamin synthesis protein P47K  36.18 
 
 
359 aa  118  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06660  predicted GTPase, G3E family  31.08 
 
 
364 aa  118  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.747392  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  37.17 
 
 
363 aa  118  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  38.2 
 
 
347 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  37.22 
 
 
350 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6439  cobalamin synthesis protein/P47K  36.18 
 
 
359 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  38.2 
 
 
353 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  31.8 
 
 
377 aa  118  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  37.78 
 
 
393 aa  117  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6056  cobalamin synthesis protein P47K  30.96 
 
 
345 aa  117  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268989  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  36.27 
 
 
378 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  39.11 
 
 
449 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0168  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.19 
 
 
357 aa  117  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  36.27 
 
 
378 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  39.11 
 
 
449 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  30.69 
 
 
324 aa  117  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  34.2 
 
 
365 aa  117  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  34.55 
 
 
355 aa  117  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  37.19 
 
 
362 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  30.63 
 
 
328 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  34.6 
 
 
324 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09841  putative cobalamin synthesis protein  29.97 
 
 
344 aa  117  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.201772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.08 
 
 
345 aa  117  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0634  cobalamin synthesis protein/P47K  36.71 
 
 
369 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  37.57 
 
 
358 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.78 
 
 
374 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3924  cobalamin synthesis protein P47K  30.31 
 
 
344 aa  116  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0777863  normal  0.0144678 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0193  CobW/P47K family protein  37.69 
 
 
358 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.294373  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3256  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.69 
 
 
358 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162964  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  36.46 
 
 
367 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2918  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.69 
 
 
358 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0872325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0389  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.69 
 
 
358 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  30.28 
 
 
347 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  34.08 
 
 
380 aa  116  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2171  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.69 
 
 
358 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338794  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0205  CobW/P47K family protein  37.69 
 
 
358 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>