More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3546 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
924 aa  1902    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  35.47 
 
 
528 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  34.44 
 
 
337 aa  141  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
477 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  31.7 
 
 
792 aa  122  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  35.88 
 
 
753 aa  118  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  32.79 
 
 
413 aa  111  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 
305 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  28.15 
 
 
305 aa  109  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  26.23 
 
 
422 aa  109  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  28.57 
 
 
403 aa  104  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0508  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
351 aa  104  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.239818  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 
333 aa  103  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  33.18 
 
 
236 aa  102  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.87 
 
 
327 aa  102  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.87 
 
 
327 aa  102  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  34.87 
 
 
327 aa  102  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  34.87 
 
 
327 aa  102  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.36 
 
 
327 aa  101  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  34.36 
 
 
327 aa  101  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.17 
 
 
327 aa  101  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 
328 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 
328 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 
308 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
428 aa  99.8  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  24.79 
 
 
335 aa  100  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
310 aa  99.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  31.84 
 
 
310 aa  99  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
302 aa  97.8  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
426 aa  97.8  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 
312 aa  97.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  32.88 
 
 
313 aa  96.3  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 
748 aa  95.9  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  30.43 
 
 
461 aa  95.9  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
841 aa  95.9  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 
318 aa  95.1  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
344 aa  95.1  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  25.78 
 
 
411 aa  94.7  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
311 aa  94.7  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
394 aa  94.7  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
304 aa  94.4  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  28.51 
 
 
838 aa  94  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 
344 aa  94  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 
344 aa  94  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 
513 aa  94.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
321 aa  93.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  25.19 
 
 
425 aa  92.8  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  25.19 
 
 
425 aa  92.8  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  33.16 
 
 
233 aa  92.8  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  24.46 
 
 
424 aa  92  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3678  glycosyl transferase family 2  28.94 
 
 
289 aa  91.7  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  29.36 
 
 
412 aa  91.7  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  29.36 
 
 
412 aa  91.3  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  24.36 
 
 
418 aa  91.3  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  29.36 
 
 
441 aa  90.9  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 
441 aa  90.9  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 
325 aa  90.9  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  29.36 
 
 
441 aa  90.9  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1586  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
444 aa  90.9  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807446  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  29.36 
 
 
441 aa  90.9  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  29.36 
 
 
441 aa  90.9  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  27.39 
 
 
429 aa  90.5  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
460 aa  90.5  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3324  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
487 aa  90.9  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.624929 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  25.7 
 
 
597 aa  90.1  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  28.14 
 
 
433 aa  90.1  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  27.04 
 
 
421 aa  89.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 
344 aa  90.1  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
309 aa  89.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
311 aa  89.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  30.36 
 
 
470 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  27.93 
 
 
442 aa  89.4  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
313 aa  89.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
470 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  26.43 
 
 
1334 aa  89.4  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 
235 aa  89.4  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  26.18 
 
 
442 aa  89.4  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  27.03 
 
 
345 aa  89.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3846  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
311 aa  89  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  27.04 
 
 
421 aa  89  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  27.04 
 
 
421 aa  88.6  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  25.98 
 
 
355 aa  89  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 
328 aa  88.6  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  29 
 
 
345 aa  88.6  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  28.97 
 
 
316 aa  87.8  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  26.64 
 
 
412 aa  87.8  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1449  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
321 aa  87.8  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.192558  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 
313 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  26.36 
 
 
315 aa  87  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 
313 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  24.38 
 
 
322 aa  87.4  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
525 aa  87  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  27.73 
 
 
754 aa  87  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  27.89 
 
 
752 aa  86.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  29.8 
 
 
988 aa  87  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
994 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
841 aa  87  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
470 aa  86.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 
260 aa  86.3  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0353  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
312 aa  86.3  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000439981  normal  0.42611 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>