More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3465 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  100 
 
 		 703 aa  1446    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  44.23 
 
 		 657 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  43.56 
 
 		 657 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  42.63 
 
 		 657 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.12 
 
 		 662 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.17 
 
 		 654 aa  443  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  43.36 
 
 		 660 aa  438  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  41.27 
 
 		 656 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  40.92 
 
 		 657 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  37.44 
 
 		 586 aa  380  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.65 
 
 		 645 aa  379  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  38.64 
 
 		 690 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  40.51 
 
 		 708 aa  372  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  36.64 
 
 		 675 aa  362  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  35.86 
 
 		 729 aa  353  5e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.15 
 
 		 710 aa  353  7e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.74 
 
 		 654 aa  353  8e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.06 
 
 		 644 aa  350  4e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  35.1 
 
 		 671 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.74 
 
 		 708 aa  345  2e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  35.73 
 
 		 695 aa  341  2.9999999999999998e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  36.36 
 
 		 580 aa  340  5.9999999999999996e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  36.84 
 
 		 740 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  35.74 
 
 		 582 aa  336  7e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  36.84 
 
 		 577 aa  336  7e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3905  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.99 
 
 		 675 aa  335  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3821  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.17 
 
 		 675 aa  334  4e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  34.15 
 
 		 711 aa  333  5e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  35.17 
 
 		 580 aa  333  8e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3765  peptidoglycan glycosyltransferase  37.3 
 
 		 675 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870412  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  36.11 
 
 		 607 aa  331  2e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  35.64 
 
 		 577 aa  330  4e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  36.07 
 
 		 582 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.4 
 
 		 570 aa  328  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  36.53 
 
 		 583 aa  326  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  34.34 
 
 		 614 aa  324  3e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.95 
 
 		 582 aa  324  3e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  35.27 
 
 		 581 aa  324  4e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  34.95 
 
 		 582 aa  324  4e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  35.19 
 
 		 705 aa  323  9.000000000000001e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.19 
 
 		 588 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  34.92 
 
 		 713 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  34.39 
 
 		 578 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.22 
 
 		 582 aa  319  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  35.92 
 
 		 631 aa  318  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  35.37 
 
 		 630 aa  318  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.59 
 
 		 582 aa  317  4e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  34.69 
 
 		 578 aa  317  6e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  34.16 
 
 		 577 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.17 
 
 		 577 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  35.48 
 
 		 653 aa  315  2.9999999999999996e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  35.02 
 
 		 630 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  35.78 
 
 		 727 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  33.62 
 
 		 631 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  33.81 
 
 		 618 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.43 
 
 		 553 aa  313  7.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  33.8 
 
 		 594 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  33.8 
 
 		 594 aa  312  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  33.8 
 
 		 594 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  33.8 
 
 		 594 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  33.8 
 
 		 594 aa  312  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  33.8 
 
 		 594 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  37.66 
 
 		 708 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  33.63 
 
 		 594 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  34.41 
 
 		 548 aa  310  5e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  36.55 
 
 		 605 aa  310  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  34.41 
 
 		 552 aa  310  5.9999999999999995e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.38 
 
 		 571 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 		 632 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 		 632 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 		 632 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  34.35 
 
 		 596 aa  308  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  35.3 
 
 		 638 aa  306  6e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  35.61 
 
 		 600 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.59 
 
 		 689 aa  303  8.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  35.55 
 
 		 644 aa  303  9e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.84 
 
 		 704 aa  302  1e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  34.59 
 
 		 595 aa  301  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  34.26 
 
 		 575 aa  301  3e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  34.71 
 
 		 585 aa  299  9e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  32.74 
 
 		 719 aa  300  9e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  33.86 
 
 		 579 aa  298  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  36.01 
 
 		 646 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0562  peptidoglycan glycosyltransferase  33.28 
 
 		 577 aa  298  2e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.445743  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  34.54 
 
 		 578 aa  298  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  35.53 
 
 		 568 aa  297  6e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0175  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.54 
 
 		 590 aa  296  7e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  34.81 
 
 		 615 aa  296  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.55 
 
 		 561 aa  295  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.35 
 
 		 702 aa  295  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  32.37 
 
 		 594 aa  295  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.05 
 
 		 595 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  34.02 
 
 		 615 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.37 
 
 		 594 aa  295  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  34.02 
 
 		 615 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  36.22 
 
 		 649 aa  294  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.05 
 
 		 595 aa  294  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  33.27 
 
 		 578 aa  294  4e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  33.28 
 
 		 587 aa  294  5e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  34.85 
 
 		 645 aa  294  5e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>