141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3450 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  100 
 
 		 436 aa  870    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  44.95 
 
 		 421 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  38.61 
 
 		 427 aa  281  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  38.13 
 
 		 427 aa  278  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  37.19 
 
 		 427 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  39.47 
 
 		 427 aa  276  4e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  38.37 
 
 		 427 aa  274  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  38.74 
 
 		 427 aa  273  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  38.13 
 
 		 427 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  38.13 
 
 		 427 aa  271  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  38.13 
 
 		 427 aa  271  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  38.13 
 
 		 427 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  38.13 
 
 		 427 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  38.88 
 
 		 454 aa  258  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 		 424 aa  248  1e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  36.32 
 
 		 408 aa  248  2e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0406  major facilitator superfamily MFS_1  38.74 
 
 		 404 aa  238  1e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  34.78 
 
 		 425 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  36.73 
 
 		 412 aa  230  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  34.46 
 
 		 440 aa  226  7e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1720  major facilitator transporter  40 
 
 		 454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.493867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  34.35 
 
 		 453 aa  204  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 		 421 aa  201  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  34.35 
 
 		 453 aa  199  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  31.57 
 
 		 425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 416 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  34.2 
 
 		 451 aa  193  5e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  30.7 
 
 		 474 aa  192  7e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  34.01 
 
 		 428 aa  192  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 439 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  30.48 
 
 		 437 aa  190  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 465 aa  187  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  33.26 
 
 		 446 aa  187  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2748  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 439 aa  186  9e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437943  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 		 419 aa  183  5.0000000000000004e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1276  hypothetical protein  32.04 
 
 		 431 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  33.41 
 
 		 460 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 430 aa  179  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  33.41 
 
 		 448 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 		 458 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 450 aa  172  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 442 aa  172  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  31.62 
 
 		 435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14630  major facilitator superfamily permease  30.7 
 
 		 462 aa  167  4e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415319 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2003  permease  27.6 
 
 		 435 aa  167  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  31.29 
 
 		 451 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  29.64 
 
 		 458 aa  163  6e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 572 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  28.44 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  28.44 
 
 		 460 aa  153  5.9999999999999996e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 447 aa  152  8e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3411  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 469 aa  151  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2670  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 458 aa  149  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.88531  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12428  hypothetical protein  27.55 
 
 		 441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0597064  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 429 aa  147  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  26.75 
 
 		 424 aa  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0150  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 443 aa  145  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  27.32 
 
 		 424 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2342  hypothetical protein  32 
 
 		 464 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968844 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2485  hypothetical protein  32.4 
 
 		 464 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 460 aa  126  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 462 aa  126  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 426 aa  123  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 		 465 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  25.44 
 
 		 455 aa  119  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3264  hypothetical protein  27.72 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 463 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 467 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  24.84 
 
 		 462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0387  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0133748  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  26.46 
 
 		 430 aa  110  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 492 aa  111  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1217  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 432 aa  110  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 474 aa  110  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 466 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 493 aa  108  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 466 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 445 aa  107  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 469 aa  106  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 472 aa  103  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 456 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  26.08 
 
 		 440 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 436 aa  100  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0657  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 449 aa  100  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.651323  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 454 aa  99.8  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 441 aa  99.8  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 467 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 440 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 		 468 aa  95.5  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  22.79 
 
 		 463 aa  94  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 444 aa  93.2  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0179532 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>