56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3437 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3437  peptidase M28  100 
 
 
453 aa  936    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3053  peptidase M28  62.31 
 
 
325 aa  406  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.387481 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3011  peptidase M28  62.31 
 
 
325 aa  406  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844179  normal  0.067434 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1386  peptidase M28  45.87 
 
 
323 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492148  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2420  M28A family peptidase  45.87 
 
 
323 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.564351  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2428  M28 family peptidase  48.69 
 
 
273 aa  250  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3438  peptidase M28  48.24 
 
 
321 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.346638  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  37.41 
 
 
308 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  33.43 
 
 
347 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  37.41 
 
 
335 aa  170  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1307  peptidase M28  33.1 
 
 
299 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0681394  normal  0.0392161 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0187  peptidase M28  30.85 
 
 
356 aa  131  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  34.38 
 
 
282 aa  126  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1467  peptidase M28  31.11 
 
 
305 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3219  peptidase M28  30.96 
 
 
306 aa  100  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.115329  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1044  peptidase M28  29.89 
 
 
306 aa  97.4  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202745 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  31.63 
 
 
339 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  28.41 
 
 
333 aa  87.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  26.54 
 
 
775 aa  63.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  38.32 
 
 
454 aa  60.5  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  26.55 
 
 
312 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  28.32 
 
 
342 aa  57.4  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0019  hypothetical protein  28.74 
 
 
319 aa  55.5  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  25.35 
 
 
437 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  40.43 
 
 
436 aa  55.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  28.32 
 
 
322 aa  54.3  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1664  peptidase M28  33.65 
 
 
479 aa  53.1  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  26.07 
 
 
373 aa  53.1  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  28.57 
 
 
313 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  28.16 
 
 
947 aa  53.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  23.74 
 
 
1247 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  34 
 
 
463 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  23.92 
 
 
352 aa  50.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  21.43 
 
 
323 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  26.79 
 
 
502 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  26.87 
 
 
1103 aa  49.7  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  31.68 
 
 
440 aa  49.3  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  28.35 
 
 
308 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  30.08 
 
 
1147 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  31.75 
 
 
391 aa  47.8  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  28.65 
 
 
1077 aa  47  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  25.14 
 
 
519 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  35.56 
 
 
512 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  31.78 
 
 
598 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2070  peptidase M28  27.69 
 
 
309 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  25 
 
 
677 aa  44.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  40.3 
 
 
440 aa  45.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  30.08 
 
 
459 aa  44.3  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0003  peptidase M28  34.04 
 
 
319 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  26.22 
 
 
315 aa  43.9  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0032  hypothetical protein  25.1 
 
 
397 aa  43.9  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  28.83 
 
 
512 aa  43.9  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  24.74 
 
 
393 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0031  hypothetical protein  25.4 
 
 
397 aa  43.9  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1748  peptidase M28  23.11 
 
 
430 aa  43.5  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  26.89 
 
 
1131 aa  43.1  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>