247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3419 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3419  methyltransferase type 11  100 
 
 		 261 aa  541  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381882 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1825  methyltransferase type 11  41.5 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627869  normal  0.366066 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 249 aa  185  5e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0585  methyltransferase type 11  37.45 
 
 		 253 aa  185  8e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  36.96 
 
 		 253 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1075  hypothetical protein  36.61 
 
 		 250 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238827  normal  0.291334 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1685  hypothetical protein  36.63 
 
 		 264 aa  168  6e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2976  hypothetical protein  34.52 
 
 		 250 aa  165  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3977  normal  0.29484 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1584  methyltransferase type 11  36.1 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1585  hypothetical protein  36.68 
 
 		 256 aa  155  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 390 aa  155  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04067  SAM-dependent methyltransferase  35.6 
 
 		 390 aa  152  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 391 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4877  methyltransferase type 11  33.07 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 390 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8125  acetyltransferase-like protein  33.2 
 
 		 464 aa  138  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2073  methyltransferase type 12  39.09 
 
 		 239 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131474  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0064  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0250  MerR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 392 aa  125  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.757542 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0938  MerR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 398 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  29.62 
 
 		 247 aa  122  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0966  putative transcriptional regulator  28.69 
 
 		 392 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7265  MerR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 391 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2724  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.16 
 
 		 239 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1382  methyltransferase type 12  33.06 
 
 		 239 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00680014  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1961  methyltransferase type 12  29.55 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00015321  normal  0.48171 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2592  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.5 
 
 		 424 aa  66.2  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0767  hypothetical protein  41.75 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0255585  normal  0.0371895 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4606  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.94 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  hitchhiker  0.0000312822 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  28.48 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.82 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0492  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.09 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  33 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2136  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.49 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000408941 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  25.27 
 
 		 343 aa  57  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1748  hypothetical protein  26.42 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.245631 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3041  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.54 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.178354 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.03 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0451  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.9 
 
 		 426 aa  56.2  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.291736  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0457  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.9 
 
 		 426 aa  56.2  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.566128  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  33.64 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2157  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.44 
 
 		 434 aa  55.8  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016063  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  30.95 
 
 		 392 aa  55.8  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0050  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.89 
 
 		 471 aa  55.5  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1910  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.33 
 
 		 420 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  27.63 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  31.06 
 
 		 541 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  23.33 
 
 		 377 aa  53.1  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  23.04 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2964  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.98 
 
 		 408 aa  53.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.151793 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  31.93 
 
 		 360 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  31.36 
 
 		 541 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  31.36 
 
 		 541 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  31.06 
 
 		 541 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2646  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 248 aa  52.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3122  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.66 
 
 		 421 aa  52  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04172  predicted methyltransferase  27.22 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3693  Methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2293  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.11 
 
 		 414 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000690855 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04134  hypothetical protein  27.22 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  28.71 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2375  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.5 
 
 		 494 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 301 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1504  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.71 
 
 		 409 aa  51.2  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.250201  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0565  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.75 
 
 		 426 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.567073  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  29 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  35 
 
 		 360 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  31.06 
 
 		 214 aa  50.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0298  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.14 
 
 		 254 aa  50.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73140  hypothetical protein  28.89 
 
 		 394 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  25.16 
 
 		 580 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 240 aa  49.3  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  27.84 
 
 		 205 aa  49.3  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 255 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 247 aa  49.3  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3143  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.55 
 
 		 392 aa  48.5  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.860131  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1711  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.47 
 
 		 447 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0226099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3473  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.37 
 
 		 415 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449759 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  34.65 
 
 		 414 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2241  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2417  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.25 
 
 		 414 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  24.36 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2603  Methyltransferase type 11  29.22 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  37.86 
 
 		 407 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.62 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2368  putative methyltransferase  27.83 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0147132  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1460  methyltransferase type 11  32.1 
 
 		 295 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  26.04 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  21.61 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  30.91 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1594  methyltransferase type 11  30.21 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>