226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3392 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 253 aa  515  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 		 255 aa  275  5e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  51.6 
 
 		 256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  47.6 
 
 		 255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  47.6 
 
 		 255 aa  269  4e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  47.2 
 
 		 255 aa  268  5e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  50 
 
 		 251 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  51.21 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  48.99 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  46.8 
 
 		 250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  51.84 
 
 		 251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  46.8 
 
 		 250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  50 
 
 		 258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 		 254 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  48.4 
 
 		 254 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  48.99 
 
 		 252 aa  252  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  48.02 
 
 		 254 aa  251  6e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  49.58 
 
 		 256 aa  251  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 		 257 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  51.23 
 
 		 274 aa  249  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 		 256 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  48.39 
 
 		 254 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  45.34 
 
 		 253 aa  248  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  45.34 
 
 		 253 aa  248  8e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  50 
 
 		 250 aa  246  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  48.78 
 
 		 255 aa  246  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  46.99 
 
 		 255 aa  246  3e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  47.37 
 
 		 252 aa  245  4e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  44.53 
 
 		 253 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  48.18 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  44.13 
 
 		 254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  44.53 
 
 		 253 aa  241  6e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  47.37 
 
 		 256 aa  240  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  42.8 
 
 		 252 aa  240  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  43.82 
 
 		 253 aa  239  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  43.67 
 
 		 253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  46.37 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  47.76 
 
 		 264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  48.18 
 
 		 256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0807  hypothetical protein  50 
 
 		 247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  44.13 
 
 		 253 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  46.56 
 
 		 254 aa  238  5.999999999999999e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  43.72 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 		 255 aa  237  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  43.72 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  44.67 
 
 		 254 aa  237  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  47.35 
 
 		 256 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  49 
 
 		 254 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 		 254 aa  236  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1958  LamB/YcsF family protein  51.01 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.289074  hitchhiker  0.00226482 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  48.02 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12450  hypothetical protein  48.56 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.858403  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  49.39 
 
 		 255 aa  233  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  48.77 
 
 		 261 aa  231  9e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  49.59 
 
 		 255 aa  229  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  43.37 
 
 		 252 aa  229  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5650  LamB/YcsF family protein  44.8 
 
 		 255 aa  228  7e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4098  LamB/YcsF family protein  48.97 
 
 		 259 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  49 
 
 		 255 aa  228  7e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1341  LamB/YcsF family protein  46.03 
 
 		 255 aa  228  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58540  hypothetical protein  47.54 
 
 		 251 aa  228  8e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1829  LamB/YcsF family protein  46.03 
 
 		 242 aa  227  1e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  49.18 
 
 		 257 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  47.98 
 
 		 262 aa  226  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4577  LamB/YcsF family protein  48.97 
 
 		 258 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.701806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  45.34 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1312  LamB/YcsF family protein  48.97 
 
 		 258 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3140  LamB/YcsF family protein  45.6 
 
 		 258 aa  226  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5125  hypothetical protein  48.12 
 
 		 251 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  46.94 
 
 		 255 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0716  LamB/YcsF family protein  46.64 
 
 		 246 aa  224  8e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0495612  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5814  LamB/YcsF family protein  44.62 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.0676141 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  45.75 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  46.22 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1029  LamB/YcsF family protein  49.17 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  48.77 
 
 		 304 aa  223  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  49.19 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2788  LamB/YcsF family protein  48.57 
 
 		 251 aa  222  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  47.77 
 
 		 256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3877  LamB/YcsF family protein  46.75 
 
 		 259 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.441072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1723  hypothetical protein  44.58 
 
 		 266 aa  221  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0366  hypothetical protein  44.58 
 
 		 266 aa  221  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0274  hypothetical protein  44.58 
 
 		 266 aa  221  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  43.72 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  45.9 
 
 		 273 aa  219  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  47.95 
 
 		 249 aa  219  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3378  LamB/YcsF family protein  46.72 
 
 		 249 aa  219  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  0.571628 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1880  hypothetical protein  44.18 
 
 		 266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6367  hypothetical protein  46.64 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0512992  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0893  hypothetical protein  44.18 
 
 		 266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1179  hypothetical protein  44.18 
 
 		 266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2156  hypothetical protein  44.18 
 
 		 266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06420  hypothetical protein  44.58 
 
 		 252 aa  218  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  45.45 
 
 		 254 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  45.45 
 
 		 254 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  45.45 
 
 		 254 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2917  LamB/YcsF family protein  45.08 
 
 		 256 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2936  LamB/YcsF family protein  44.18 
 
 		 251 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1405  LamB/YcsF family protein  45.68 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37270  LamB/YcsF family protein  48.35 
 
 		 247 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000305457  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>