More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3386 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
298 aa  592  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  54.73 
 
 
314 aa  287  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  38.33 
 
 
304 aa  137  3e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0020  PfkB domain protein  34.04 
 
 
291 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0022  PfkB domain protein  33.69 
 
 
291 aa  127  2e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2455  PfkB domain-containing protein  37.88 
 
 
282 aa  127  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.287722  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  36.27 
 
 
321 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1019  PfkB domain protein  36.33 
 
 
284 aa  123  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.485278 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  35.95 
 
 
324 aa  122  1e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4406  PfkB family kinase  35.37 
 
 
298 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03768  predicted sugar kinase  35.37 
 
 
298 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  35.37 
 
 
298 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4103  PfkB domain protein  35.37 
 
 
298 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03717  hypothetical protein  35.37 
 
 
298 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  35.37 
 
 
298 aa  120  4e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  35.37 
 
 
298 aa  120  4e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  35.37 
 
 
298 aa  120  4e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  35.37 
 
 
298 aa  120  4e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0358  ribokinase-like domain-containing protein  34.75 
 
 
306 aa  119  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4103  PfkB family kinase  35.37 
 
 
298 aa  119  8e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4140  ribokinase-like domain-containing protein  35.37 
 
 
298 aa  119  8e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.682006  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4268  PfkB family kinase  35.03 
 
 
298 aa  118  1e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  35.29 
 
 
295 aa  118  2e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  35.03 
 
 
298 aa  115  8e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5330  kinase, PfkB family  34.69 
 
 
298 aa  114  2e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.574224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1940  PfkB  31.21 
 
 
294 aa  113  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123547  normal  0.0238447 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4029  carbohydrate kinase, PfkB  36.86 
 
 
299 aa  113  4e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3654  PfkB  32.87 
 
 
300 aa  113  4e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1648  PfkB  32.29 
 
 
297 aa  112  7e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46421  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  31.77 
 
 
304 aa  112  1e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  29.19 
 
 
297 aa  112  1e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  2.25274e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5201  PfkB domain protein  33.77 
 
 
326 aa  111  1e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  33 
 
 
302 aa  110  4e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2838  putative sugar kinase  32.99 
 
 
299 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1805  PfkB  32.53 
 
 
318 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4302  PfkB domain protein  32.99 
 
 
297 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  30.97 
 
 
308 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5483  PfkB domain protein  36 
 
 
313 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  27.42 
 
 
299 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1913  PfkB domain-containing protein  29.54 
 
 
288 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0090  PfkB  33.88 
 
 
309 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  27 
 
 
304 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  31.88 
 
 
305 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  33.11 
 
 
304 aa  106  5e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0671  PfkB  33.11 
 
 
309 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  28.47 
 
 
301 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2334  PfkB domain protein  31.49 
 
 
314 aa  105  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0161012  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1986  PfkB  31.54 
 
 
286 aa  105  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.842187 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  30.16 
 
 
305 aa  104  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  28.43 
 
 
313 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  26.17 
 
 
304 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1546  PfkB domain protein  27.53 
 
 
285 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418317 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  23.39 
 
 
306 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38340  sugar kinase, ribokinase  34.8 
 
 
288 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4851  PfkB  33.77 
 
 
309 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0616  PfkB domain protein  32.33 
 
 
312 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  31.42 
 
 
295 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  28.66 
 
 
308 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1888  PfkB  33.67 
 
 
323 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.389987  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  31.74 
 
 
296 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  26.09 
 
 
298 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  27.21 
 
 
311 aa  99.4  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1475  ribokinase-like domain-containing protein  30.51 
 
 
305 aa  99.4  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5021  PfkB domain protein  36.98 
 
 
311 aa  98.6  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  25.75 
 
 
298 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0460  PfkB  31.67 
 
 
308 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.413409  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5220  PfkB domain protein  35.2 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.946183  normal  0.655823 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  29.17 
 
 
295 aa  97.1  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  25.99 
 
 
298 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  25.99 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  25.99 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  25.66 
 
 
298 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  26.53 
 
 
298 aa  96.7  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  6.79387e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  26.23 
 
 
298 aa  96.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  25.5 
 
 
298 aa  96.3  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  27.46 
 
 
297 aa  95.9  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  25.66 
 
 
298 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  28.85 
 
 
295 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  28.81 
 
 
305 aa  95.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  25.66 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  26.17 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  31.89 
 
 
297 aa  94  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  27.81 
 
 
305 aa  93.6  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  30.03 
 
 
316 aa  94  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  30.82 
 
 
308 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  25.25 
 
 
306 aa  91.7  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  29.67 
 
 
312 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  30.77 
 
 
300 aa  91.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  33.22 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  24.68 
 
 
309 aa  91.3  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  30.65 
 
 
308 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  29.14 
 
 
305 aa  90.5  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  30.1 
 
 
302 aa  90.1  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  30.72 
 
 
296 aa  89.4  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  28.98 
 
 
318 aa  89.4  7e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  29.51 
 
 
306 aa  89.4  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  29.87 
 
 
310 aa  89  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  27.83 
 
 
307 aa  88.2  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  31.31 
 
 
308 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  29.93 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>