46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3381 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3381  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  398  1e-110  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1053  hypothetical protein  63.49 
 
 
197 aa  243  9e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.593896  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1317  protein of unknown function DUF147  46.3 
 
 
649 aa  144  7e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.521946  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1780  hypothetical protein  48.25 
 
 
443 aa  142  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0489  hypothetical protein  46.26 
 
 
268 aa  138  6e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0788  hypothetical protein  44.38 
 
 
310 aa  137  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0099  hypothetical protein  43.12 
 
 
310 aa  135  4e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.892669  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0723  hypothetical protein  43.12 
 
 
310 aa  135  4e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0286471 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1210  putative PAS/PAC sensor protein  46.26 
 
 
540 aa  134  6e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0526078  normal  0.0174457 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1195  hypothetical protein  43.12 
 
 
310 aa  132  2e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0839  hypothetical protein  48.2 
 
 
270 aa  132  2e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.286364  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1579  hypothetical protein  42.57 
 
 
291 aa  132  4e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1190  protein of unknown function DUF147  42.33 
 
 
456 aa  130  2e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2466  protein of unknown function DUF147  39.63 
 
 
270 aa  130  2e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2555  hypothetical protein  46.05 
 
 
277 aa  129  2e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338009  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1389  hypothetical protein  41.89 
 
 
293 aa  129  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0634969  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0504  protein of unknown function DUF147  39.02 
 
 
270 aa  129  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1394  protein of unknown function DUF147  44.74 
 
 
294 aa  127  7e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0782856  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1293  protein of unknown function DUF147  44.74 
 
 
294 aa  127  7e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.964954  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0310  hypothetical protein  49.28 
 
 
288 aa  127  9e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0301  protein of unknown function DUF147  39.02 
 
 
268 aa  126  2e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0317825  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1944  protein of unknown function DUF147  45.59 
 
 
265 aa  125  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0381023  normal  0.0659541 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1442  protein of unknown function DUF147  40.24 
 
 
269 aa  125  4e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2246  protein of unknown function DUF147  39.33 
 
 
269 aa  125  4e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.217243 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1616  putative PAS/PAC sensor protein  40.14 
 
 
559 aa  122  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.477909  normal  0.117342 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1308  hypothetical protein  43.24 
 
 
294 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.832333  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4591  hypothetical protein  41.67 
 
 
446 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0075  protein of unknown function DUF147  33.74 
 
 
265 aa  94  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.104264  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2337  protein of unknown function DUF147  28.97 
 
 
276 aa  46.2  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0006  protein of unknown function DUF147  38.6 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  1.63488e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1515  hypothetical protein  45.45 
 
 
249 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.189008  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13513  putative transmembrane protein  42.11 
 
 
259 aa  44.3  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1145  hypothetical protein  33.33 
 
 
279 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586351 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3986  hypothetical protein  33.33 
 
 
294 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0146  protein of unknown function DUF147  37.5 
 
 
269 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1568  hypothetical protein  40.35 
 
 
273 aa  43.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2107  protein of unknown function DUF147  37.68 
 
 
258 aa  43.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0224  protein of unknown function DUF147  32 
 
 
267 aa  42.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  4.24846e-09  normal  0.0474831 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3055  protein of unknown function DUF147  33.78 
 
 
382 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0416862  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1817  protein of unknown function DUF147  35.9 
 
 
266 aa  42.4  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0604  protein of unknown function DUF147  40.35 
 
 
275 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  6.75285e-08  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0156  protein of unknown function DUF147  41.18 
 
 
273 aa  42.4  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  6.02517e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1725  protein of unknown function DUF147  25.93 
 
 
252 aa  42.4  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.175281  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2103  hypothetical protein  35.14 
 
 
288 aa  42  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5466  protein of unknown function DUF147  32.93 
 
 
270 aa  42  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200654  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0278  hypothetical protein  36 
 
 
292 aa  41.2  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911032  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>