More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3364 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  100 
 
 
412 aa  814  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  33.42 
 
 
418 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  34.37 
 
 
397 aa  193  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  32.24 
 
 
411 aa  189  8e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
415 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  34.83 
 
 
425 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  35.58 
 
 
421 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  35.06 
 
 
421 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2465  major facilitator transporter  34.85 
 
 
454 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 
416 aa  176  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  34.82 
 
 
421 aa  174  2e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 
407 aa  174  2e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  35.32 
 
 
418 aa  173  5e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  31.98 
 
 
412 aa  172  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  35.03 
 
 
442 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  32.29 
 
 
412 aa  169  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  3.77663e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 
434 aa  169  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  28.54 
 
 
402 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  28.54 
 
 
402 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  34.09 
 
 
410 aa  168  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  32.57 
 
 
410 aa  166  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2490  oxalate/formate antiporter, putative  32.82 
 
 
455 aa  166  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  28.64 
 
 
398 aa  163  5e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  28.64 
 
 
398 aa  163  5e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  28.64 
 
 
398 aa  163  5e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  32.08 
 
 
424 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  28.4 
 
 
398 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  30.12 
 
 
436 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  28.4 
 
 
398 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  30.12 
 
 
436 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  29.6 
 
 
404 aa  160  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  28.89 
 
 
402 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83174e-08 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  28.21 
 
 
402 aa  160  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  28.89 
 
 
402 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
407 aa  159  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  30.12 
 
 
436 aa  159  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  29.13 
 
 
429 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  28.64 
 
 
402 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  31.96 
 
 
419 aa  157  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 
405 aa  157  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  28.24 
 
 
402 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  3.11684e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 
408 aa  155  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 
433 aa  153  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 
430 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 
421 aa  153  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  28.57 
 
 
437 aa  152  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  28.15 
 
 
402 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.21238e-05 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  28.8 
 
 
400 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  28.27 
 
 
402 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  29.3 
 
 
436 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2629  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 
465 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 
429 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 
407 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  27.86 
 
 
402 aa  150  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  26.85 
 
 
408 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  29.69 
 
 
437 aa  149  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 
424 aa  149  1e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  26.89 
 
 
430 aa  148  2e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 
441 aa  147  2e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 
430 aa  148  2e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  28.81 
 
 
437 aa  148  2e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  30.84 
 
 
419 aa  147  2e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  32.6 
 
 
430 aa  147  4e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 
411 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  27.95 
 
 
400 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  27.52 
 
 
422 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  30.22 
 
 
438 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  2.66277e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 
437 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 
437 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 
430 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  28.99 
 
 
429 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  28.99 
 
 
429 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  26.21 
 
 
402 aa  144  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  30.38 
 
 
442 aa  143  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  28.28 
 
 
425 aa  143  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  27.4 
 
 
431 aa  142  1e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  28.5 
 
 
439 aa  142  1e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  27.95 
 
 
400 aa  142  2e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  27.18 
 
 
400 aa  141  2e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 
405 aa  141  2e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  28.98 
 
 
424 aa  140  4e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  25.73 
 
 
402 aa  140  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  25.73 
 
 
402 aa  140  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  25.73 
 
 
402 aa  140  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0904  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 
393 aa  140  6e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  25.73 
 
 
400 aa  138  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  25.73 
 
 
402 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  27.44 
 
 
400 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  27.44 
 
 
400 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  28.05 
 
 
402 aa  137  3e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  27.44 
 
 
400 aa  137  3e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  32.92 
 
 
432 aa  137  3e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  27.44 
 
 
400 aa  137  3e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  25.49 
 
 
402 aa  137  3e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  27.44 
 
 
400 aa  137  3e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  25.49 
 
 
402 aa  137  3e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  27.88 
 
 
431 aa  137  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  26.63 
 
 
412 aa  137  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 
436 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  27.1 
 
 
447 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>