More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3348 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3348  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
315 aa  644    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4911  family 2 glycosyl transferase  32.93 
 
 
316 aa  131  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  35.38 
 
 
300 aa  125  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 
581 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
1035 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
333 aa  112  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  37.8 
 
 
689 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  35.75 
 
 
306 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  32.98 
 
 
289 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  32.23 
 
 
333 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
305 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  31.68 
 
 
352 aa  106  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
313 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  46.46 
 
 
230 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
302 aa  102  8e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
1032 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 
310 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  33.78 
 
 
386 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  41.54 
 
 
253 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2781  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
295 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  42.42 
 
 
597 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 
299 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  34.93 
 
 
320 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
326 aa  99.8  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14251  hypothetical protein  29.39 
 
 
218 aa  99.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.485314  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
303 aa  98.2  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  28.1 
 
 
296 aa  99  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.82 
 
 
326 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  35.65 
 
 
326 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  43.75 
 
 
310 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.67 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 
337 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 
317 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.04 
 
 
326 aa  97.4  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  35.65 
 
 
326 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
366 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  32.27 
 
 
398 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  34.9 
 
 
362 aa  96.7  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  42.61 
 
 
325 aa  97.1  4e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  41.44 
 
 
328 aa  96.7  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.67 
 
 
251 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2347  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 
295 aa  96.3  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 
235 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 
301 aa  95.9  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
318 aa  95.9  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
318 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
268 aa  95.1  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  34.53 
 
 
334 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 
326 aa  95.1  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  29.04 
 
 
373 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  33.58 
 
 
746 aa  94.4  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  41.18 
 
 
374 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 
347 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
233 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  41.23 
 
 
289 aa  94  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  43.43 
 
 
345 aa  94  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0614  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  35.53 
 
 
529 aa  94.4  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  33.95 
 
 
322 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 
294 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 
336 aa  92.8  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  40.34 
 
 
337 aa  92.8  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  40.59 
 
 
380 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 
268 aa  92  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
247 aa  92  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  35 
 
 
323 aa  91.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  42 
 
 
327 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 
390 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  31.79 
 
 
276 aa  90.9  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0726  putative glycosyltransferase protein  48.91 
 
 
349 aa  91.7  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 
331 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
235 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
289 aa  90.5  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  36 
 
 
341 aa  90.1  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.38 
 
 
324 aa  90.1  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  36.75 
 
 
390 aa  90.1  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.36 
 
 
310 aa  89.7  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  32.12 
 
 
455 aa  89.7  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
365 aa  89.4  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  29.74 
 
 
299 aa  89  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  27.13 
 
 
746 aa  89  9e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  31.34 
 
 
340 aa  89  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3090  glycosyl transferase family protein  34.18 
 
 
310 aa  89  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.933883  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
1015 aa  89  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  38.46 
 
 
333 aa  89  9e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
314 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2965  glycosyl transferase family 2  40.68 
 
 
309 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.23 
 
 
327 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 
316 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2704  glycosyl transferase family 2  34.2 
 
 
278 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00294002 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  36.44 
 
 
312 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  30.46 
 
 
334 aa  87.8  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  38.14 
 
 
344 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  41 
 
 
337 aa  87.4  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  28.7 
 
 
300 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  47.37 
 
 
373 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  34.38 
 
 
353 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
344 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  27.6 
 
 
672 aa  87  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 
333 aa  87  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>