68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3329 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3329  heparinase II/III family protein  100 
 
 
528 aa  1066    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  35.81 
 
 
561 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  36.02 
 
 
557 aa  272  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23430  putative heparinase  35.11 
 
 
550 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000712421  hitchhiker  0.00765921 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00700  hypothetical protein  34.61 
 
 
541 aa  243  7.999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0809  heparinase II/III family protein  31.99 
 
 
547 aa  238  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4069  Heparinase II/III family protein  31.38 
 
 
545 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2158  heparinase II/III family protein  29.56 
 
 
587 aa  150  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5558  hypothetical protein  25.27 
 
 
651 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.030932  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0083  Heparinase II/III family protein  28.07 
 
 
603 aa  145  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.137335 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08631  hypothetical protein  25.45 
 
 
600 aa  139  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143582  hitchhiker  0.00000750178 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4954  hypothetical protein  23.17 
 
 
651 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000012677  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1686  heparinase II/III family protein  32.89 
 
 
594 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1300  heparinase II/III-like  29.02 
 
 
680 aa  123  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3884  heparinase II/III family protein  33.94 
 
 
617 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0460  heparinase II/III-like protein  23.39 
 
 
627 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00058619  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3419  heparinase II/III-like  25.85 
 
 
568 aa  82.4  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.784393  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3022  heparinase II/III family protein  23.3 
 
 
657 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000040262  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3797  Heparinase II/III family protein  24.17 
 
 
670 aa  74.7  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0030  Heparinase II/III family protein  26.74 
 
 
584 aa  74.7  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3793  heparinase II/III-like  31.79 
 
 
627 aa  73.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2926  heparinase II/III family protein  27.39 
 
 
610 aa  73.9  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0433  heparinase II/III family protein  22.02 
 
 
668 aa  73.6  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0485794 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0073  heparinase II/III-like family protein  25.93 
 
 
569 aa  72.8  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000168541  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0718  heparinase II/III-like  25.73 
 
 
628 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.79901 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0157  heparinase II/III-like  26.29 
 
 
584 aa  70.9  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901723  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0024  heparinase II/III-like  25.07 
 
 
592 aa  70.5  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0324  hypothetical protein  28.9 
 
 
571 aa  69.7  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4034  Heparinase II/III family protein  22.76 
 
 
630 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0114283 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2567  heparinase II/III family protein  26.74 
 
 
570 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2790  Heparinase II/III family protein  26.74 
 
 
570 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0196  heparinase II/III-like  27.83 
 
 
584 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.9561  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2499  Heparinase II/III family protein  26.47 
 
 
570 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307447  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0471  heparinase II/III-like protein  21.49 
 
 
630 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000500761  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4294  hypothetical protein  23.27 
 
 
518 aa  68.2  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166644  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0085  heparinase II/III-like  24.81 
 
 
584 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265496  normal  0.158685 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2070  heparinase II/III family protein  27.95 
 
 
581 aa  65.1  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4968  hypothetical protein  21.92 
 
 
906 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5221  Heparinase II/III family protein  31.89 
 
 
573 aa  63.5  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452357  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1423  Heparinase II/III family protein  28.32 
 
 
569 aa  62.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.332975 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2527  Heparinase II/III family protein  23.51 
 
 
675 aa  63.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000557992 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0406  heparinase II/III-like protein  23.12 
 
 
672 aa  61.2  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.242919  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0023  heparinase II/III family protein  29.53 
 
 
524 aa  60.5  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0402  hypothetical protein  23.56 
 
 
672 aa  60.1  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.813066  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0039  heparinase II/III family protein  24.28 
 
 
614 aa  60.1  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.644544  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3190  heparinase II/III family protein  23.46 
 
 
568 aa  58.2  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2964  heparinase II/III family protein  31.1 
 
 
573 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.534511  normal  0.040363 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1088  heparinase II/III family protein  28.42 
 
 
580 aa  57  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1321  heparinase II/III family protein  24.39 
 
 
629 aa  57  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213971  hitchhiker  0.0000000859361 
 
 
-
 
NC_004310  BR1815  hypothetical protein  25.6 
 
 
543 aa  56.2  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3916  Heparinase II/III family protein  24.23 
 
 
548 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.729618  normal  0.655355 
 
 
-
 
NC_003296  RS02344  hypothetical protein  27.83 
 
 
612 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1748  hypothetical protein  25.5 
 
 
617 aa  55.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.560293  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4241  Heparinase II/III family protein  24.83 
 
 
548 aa  55.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.222931 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0124  Heparinase II/III family protein  18.23 
 
 
594 aa  53.1  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3879  Heparinase II/III family protein  33.33 
 
 
766 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5592  heparinase II/III family protein  24.86 
 
 
582 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658626  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0625  Heparinase II/III family protein  27.74 
 
 
597 aa  49.3  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.27993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8037  hypothetical protein  21.41 
 
 
560 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1891  heparinase II/III family protein  35.96 
 
 
968 aa  47.8  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.857248 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1481  Heparinase II/III family protein  37.36 
 
 
702 aa  47  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608961  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2927  heparinase II/III family protein  25.43 
 
 
565 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.0379947 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2473  heparinase II/III-like  40.58 
 
 
702 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2764  heparinase II/III family protein  25.63 
 
 
567 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1385  Heparinase II/III family protein  40.58 
 
 
702 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16373  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1101  hypothetical protein  25.91 
 
 
567 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08820  glycosyltransferase  26.58 
 
 
1188 aa  45.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.338698  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0090  heparinase II/III-like  24.76 
 
 
581 aa  44.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.379483  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>