More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3316 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3316  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 423 aa  850    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.226121 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3486  efflux pump membrane protein  37.32 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  39.69 
 
 		 374 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2027  secretion protein HlyD  36.41 
 
 		 413 aa  233  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294658  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2024  secretion protein HlyD  37.44 
 
 		 429 aa  232  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0436308  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3330  efflux pump membrane protein  37.07 
 
 		 391 aa  232  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2560  multidrug resistance protein  40.75 
 
 		 410 aa  231  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.634691  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1919  multidrug resistance protein  40.75 
 
 		 411 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1767  multidrug resistance protein  40.75 
 
 		 411 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1744  multidrug resistance protein  40.75 
 
 		 411 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  37.77 
 
 		 366 aa  229  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3014  multidrug resistance protein A  36.41 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193784 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3120  multidrug resistance protein A  36.64 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0308659 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0995  putative multidrug resistance protein  40.48 
 
 		 411 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1503  putative multidrug resistance protein  40.48 
 
 		 411 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1057  multidrug resistance protein, putative  40.48 
 
 		 411 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0394345  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2997  multidrug resistance protein A  36.41 
 
 		 390 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  38.35 
 
 		 366 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0171  putative multidrug resistance protein  40.48 
 
 		 411 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152509  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3163  efflux pump membrane protein  36.59 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0262  secretion protein HlyD family protein  40.39 
 
 		 405 aa  226  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123427 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2962  multidrug resistance protein A  36.17 
 
 		 390 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.832708  hitchhiker  0.00715907 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2931  multidrug resistance protein A  36.17 
 
 		 390 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0257  secretion protein HlyD family protein  40.39 
 
 		 402 aa  226  9e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02540  multidrug efflux system  36.34 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0999  efflux pump membrane protein  36.34 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.486081  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2807  multidrug resistance protein A  36.34 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000414824  hitchhiker  0.00826621 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02505  hypothetical protein  36.34 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1022  efflux pump membrane protein  36.34 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.727271  normal  0.0227655 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2821  multidrug resistance protein A  36.34 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3930  multidrug resistance protein A  36.34 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.725166 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2968  multidrug resistance protein A  36.34 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3201  multidrug resistance protein A  36.06 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3460  multidrug resistance protein A  36.06 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3338  efflux pump membrane protein  36.06 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.615616  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0858  efflux pump membrane protein  35.85 
 
 		 391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3743  efflux pump membrane protein  37.02 
 
 		 390 aa  219  6e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.881561  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  36.99 
 
 		 400 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3191  multidrug resistance protein A  35.85 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.168067  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3583  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  37.12 
 
 		 420 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0766049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  36.92 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  36.73 
 
 		 375 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  37.76 
 
 		 372 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1480  secretion protein HlyD family protein  36.32 
 
 		 404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1751  efflux pump membrane protein  40.74 
 
 		 407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0610226 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1024  secretion protein HlyD  36.32 
 
 		 404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1504  secretion protein HlyD family protein  36.32 
 
 		 404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226713  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1725  efflux pump membrane protein  37.16 
 
 		 406 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  34.72 
 
 		 368 aa  216  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1853  multidrug resistance transmembrane protein  39.68 
 
 		 385 aa  216  8e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.104689 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4645  HlyD family secretion protein  36.32 
 
 		 404 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109619  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1515  secretion protein HlyD  35.11 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498978  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1636  efflux pump membrane protein  37.63 
 
 		 424 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00067211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1386  secretion protein HlyD family protein  39.1 
 
 		 407 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  35.22 
 
 		 368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1426  secretion protein HlyD family protein  39.1 
 
 		 405 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0183071 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2225  secretion protein HlyD family protein  34.83 
 
 		 397 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818643  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1293  multidrug resistance A (translocase) transmembrane protein  35.71 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.538155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1445  secretion protein HlyD family protein  38.99 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1214  secretion protein HlyD family protein  36.93 
 
 		 429 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.314397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1123  secretion protein HlyD family protein  36.68 
 
 		 429 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.911317  normal  0.519674 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3549  secretion protein HlyD family protein  34.69 
 
 		 397 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2816  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  37.83 
 
 		 413 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106074  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3490  secretion protein HlyD family protein  37.66 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.592297  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01156  multidrug resistance efflux pump  36.6 
 
 		 372 aa  208  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.461805  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  32.41 
 
 		 334 aa  206  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2982  secretion protein HlyD family protein  37.33 
 
 		 400 aa  206  8e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  39.24 
 
 		 392 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3643  secretion protein HlyD  35.23 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870857  normal  0.0330116 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2373  secretion protein HlyD family protein  34.21 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  35.78 
 
 		 410 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1288  secretion protein HlyD family protein  35.77 
 
 		 392 aa  203  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  35.48 
 
 		 470 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3748  multidrug resistance protein  33.75 
 
 		 402 aa  203  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155411  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0890  efflux pump membrane protein  34.88 
 
 		 391 aa  203  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0249504  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  35.48 
 
 		 475 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  35.48 
 
 		 475 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1021  multidrug resistance protein VceA  36.91 
 
 		 395 aa  202  8e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  36.9 
 
 		 443 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  35.03 
 
 		 460 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  36.12 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  32.69 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  35.03 
 
 		 460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3235  secretion protein HlyD  37.92 
 
 		 465 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.265062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  36.36 
 
 		 383 aa  199  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4314  MFS efflux pump, membrane fusion protein, EmrA subfamily  38.34 
 
 		 423 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2021  secretion protein HlyD family protein  36.61 
 
 		 413 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0240231 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1730  secretion protein HlyD  33.25 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2078  secretion protein HlyD family protein  35.21 
 
 		 397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2468  secretion protein HlyD family protein  31.03 
 
 		 393 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  34.99 
 
 		 380 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  33.76 
 
 		 393 aa  196  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4889  HlyD family secretion protein  34.09 
 
 		 459 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.392756  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2737  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  34.26 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.778541  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  36.6 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3743  secretion protein HlyD family protein  36.88 
 
 		 453 aa  193  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00143217  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2416  secretion protein HlyD family protein  34.53 
 
 		 437 aa  193  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.975538 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1289  efflux pump membrane protein  34 
 
 		 387 aa  192  8e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2505  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  34 
 
 		 387 aa  192  8e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.012377  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02239  hypothetical protein  34 
 
 		 387 aa  192  8e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.371729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>