207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3252 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  100 
 
 
191 aa  392  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  74.87 
 
 
191 aa  305  3e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  71.28 
 
 
190 aa  278  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  68.62 
 
 
190 aa  277  5e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  69.11 
 
 
191 aa  273  8e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  69.68 
 
 
190 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  70.21 
 
 
192 aa  272  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  68.59 
 
 
191 aa  271  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  71.28 
 
 
192 aa  269  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  62.83 
 
 
191 aa  269  2e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  64.92 
 
 
191 aa  260  8e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  63.3 
 
 
190 aa  258  4e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  62.3 
 
 
191 aa  257  8e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  63.83 
 
 
192 aa  255  3e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  62.3 
 
 
191 aa  254  4e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  60.73 
 
 
191 aa  253  9e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  63.87 
 
 
191 aa  253  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  61.26 
 
 
191 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  61.29 
 
 
190 aa  235  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  56.91 
 
 
192 aa  228  6e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0633  Rubrerythrin  55.5 
 
 
191 aa  226  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000654398  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  56.38 
 
 
190 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  61.26 
 
 
178 aa  221  7e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  53.03 
 
 
197 aa  217  7e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  53.16 
 
 
191 aa  215  2.9999999999999998e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  57.45 
 
 
179 aa  214  5e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  55.32 
 
 
188 aa  214  9e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0133  rubrerythrin  52.31 
 
 
195 aa  211  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000905635  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  53.4 
 
 
191 aa  211  7.999999999999999e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0132  rubrerythrin  51.79 
 
 
195 aa  210  9e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  51.28 
 
 
196 aa  205  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  50.79 
 
 
179 aa  202  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  52.15 
 
 
178 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  49.21 
 
 
179 aa  195  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  50.53 
 
 
179 aa  194  5.000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  52.66 
 
 
177 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  50.79 
 
 
178 aa  189  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  47.62 
 
 
179 aa  188  4e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  49.74 
 
 
180 aa  188  4e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  50.79 
 
 
178 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  48.4 
 
 
179 aa  187  9e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  49.21 
 
 
178 aa  184  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  47.83 
 
 
179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  47.83 
 
 
179 aa  182  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  47.96 
 
 
196 aa  178  4e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  48.94 
 
 
177 aa  178  4.999999999999999e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  44.79 
 
 
194 aa  177  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  44.27 
 
 
194 aa  175  3e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1565  rubrerythrin  47.06 
 
 
194 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  42.71 
 
 
194 aa  170  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0325  rubrerythrin  43.52 
 
 
195 aa  170  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.560367  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  43.92 
 
 
696 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0893  Rubrerythrin  44.04 
 
 
194 aa  169  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180396  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  46.56 
 
 
221 aa  169  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  43.62 
 
 
233 aa  168  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  45.16 
 
 
696 aa  167  7e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  47.49 
 
 
181 aa  166  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  46.24 
 
 
392 aa  164  9e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0382  Rubrerythrin  45.03 
 
 
194 aa  160  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000024183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1538  rubrerythrin  40.53 
 
 
178 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1331  rubrerythrin  40.53 
 
 
178 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282824  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  41.36 
 
 
215 aa  144  6e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  40.21 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  38.14 
 
 
183 aa  127  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  38.14 
 
 
183 aa  127  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  38.14 
 
 
183 aa  127  9.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  37.57 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  36.32 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  45.77 
 
 
140 aa  108  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1185  Rubrerythrin  33.9 
 
 
164 aa  108  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958071  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  43.36 
 
 
140 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  42.66 
 
 
140 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  42.66 
 
 
140 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  41.96 
 
 
140 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  42.66 
 
 
140 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  42.66 
 
 
140 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  42.66 
 
 
140 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  42.66 
 
 
140 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  42.66 
 
 
140 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  42.66 
 
 
140 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1247  Rubrerythrin  35.43 
 
 
165 aa  105  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  44.12 
 
 
140 aa  105  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  44.78 
 
 
139 aa  105  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  41.96 
 
 
140 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  41.96 
 
 
140 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  41.96 
 
 
140 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  43.36 
 
 
140 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  43.36 
 
 
139 aa  104  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  43.36 
 
 
139 aa  104  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  43.36 
 
 
139 aa  104  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  44.85 
 
 
140 aa  104  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  44.85 
 
 
140 aa  104  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  43.7 
 
 
168 aa  104  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  41.84 
 
 
139 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  43.88 
 
 
140 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  43.36 
 
 
139 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  42.07 
 
 
140 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  38.82 
 
 
167 aa  101  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  40.71 
 
 
139 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  37.99 
 
 
185 aa  100  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>