More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3185 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3185  ribosomal protein L9  100 
 
 		 148 aa  293  6e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  48.61 
 
 		 147 aa  140  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  46.58 
 
 		 147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  49.31 
 
 		 148 aa  135  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  46.58 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  49.66 
 
 		 149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  46.62 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  44.52 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  44.52 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  45.83 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  48.3 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  48.3 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 171 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 149 aa  120  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 189 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1774  50S ribosomal protein L9  44.85 
 
 		 189 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0141  50S ribosomal protein L9  44.85 
 
 		 189 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0120  50S ribosomal protein L9  44.44 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0927016  normal  0.199932 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  41.43 
 
 		 209 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 148 aa  113  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 167 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  39.44 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 159 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 148 aa  110  8.000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  41.5 
 
 		 148 aa  110  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 167 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  106  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4414  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 190 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4307  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 190 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  41.78 
 
 		 193 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3939  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 190 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.190537 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  35.42 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  38 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4634  50S ribosomal protein L9  44.62 
 
 		 189 aa  104  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269406  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 146 aa  104  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1694  50S ribosomal protein L9  40.97 
 
 		 202 aa  104  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0817246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1516  50S ribosomal protein L9  38.97 
 
 		 191 aa  103  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101233  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  39.29 
 
 		 194 aa  103  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2593  50S ribosomal protein L9  43.85 
 
 		 189 aa  103  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0267673 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 151 aa  102  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  41.06 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3490  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 195 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  36.55 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  39.72 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5418  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 190 aa  101  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  36.84 
 
 		 165 aa  100  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 189 aa  100  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  37.86 
 
 		 204 aa  100  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  37.33 
 
 		 189 aa  100  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2415  50S ribosomal protein L9  40.97 
 
 		 202 aa  100  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295062  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  34.69 
 
 		 153 aa  100  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  34.9 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3363  ribosomal protein L9  34.93 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2293  50S ribosomal protein L9  39.39 
 
 		 198 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.14836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1918  50S ribosomal protein L9  39.29 
 
 		 196 aa  99.8  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  36.81 
 
 		 179 aa  99.8  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  39.22 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2458  50S ribosomal protein L9P  35.62 
 
 		 149 aa  98.6  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174518 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  34.44 
 
 		 147 aa  98.6  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 189 aa  98.6  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2625  ribosomal protein L9  34.03 
 
 		 167 aa  98.2  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.24643  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0411  50S ribosomal protein L9  39.26 
 
 		 195 aa  97.8  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.112533  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0654  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 150 aa  97.8  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0738  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 		 191 aa  97.1  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823068  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  38.73 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2461  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 196 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0571  ribosomal protein L9  36 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.409562  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 		 189 aa  95.9  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1510  ribosomal protein L9  38.24 
 
 		 186 aa  95.1  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1355  ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1620  50S ribosomal protein L9  42.31 
 
 		 211 aa  95.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0645747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3812  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 197 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.136797 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0222  ribosomal protein L9  37.66 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0210  ribosomal protein L9  36.11 
 
 		 172 aa  94.4  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000722973  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  38.03 
 
 		 150 aa  94  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3991  50S ribosomal protein L9  35.53 
 
 		 165 aa  93.6  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00054476 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  36.17 
 
 		 149 aa  92.8  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2988  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 194 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1642  50S ribosomal protein L9  34.9 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0557513  normal  0.0367892 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1210  50S ribosomal protein L9  35.92 
 
 		 209 aa  92.8  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0873917  normal  0.750153 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3790  ribosomal protein L9  38.73 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00574678  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0777  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000131124  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4673  50S ribosomal protein L9  38.73 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>