60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3169 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3169  SirA family protein  100 
 
 
76 aa  151  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0821  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3246  SirA family protein  47.83 
 
 
73 aa  72.4  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0904  hypothetical protein  58.18 
 
 
71 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00947642  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0063  SirA family protein  49.23 
 
 
69 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1620  SirA family protein  42.25 
 
 
71 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.591727  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  44.29 
 
 
193 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  39.13 
 
 
199 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2082  SirA family protein  44.29 
 
 
72 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  43.28 
 
 
196 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  46.03 
 
 
74 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  40 
 
 
195 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  39.39 
 
 
199 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25120  hypothetical protein  41.79 
 
 
68 aa  56.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.518593  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00550  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  44.26 
 
 
68 aa  56.6  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0248  hypothetical protein  49.18 
 
 
73 aa  56.6  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  45.31 
 
 
202 aa  55.1  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  43.08 
 
 
72 aa  53.9  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  33.85 
 
 
223 aa  53.9  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  36.51 
 
 
197 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2088  hypothetical protein  43.08 
 
 
69 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  36.92 
 
 
196 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  38.46 
 
 
195 aa  51.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  43.1 
 
 
204 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  39.68 
 
 
195 aa  50.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  36.92 
 
 
193 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1060  hypothetical protein  35.82 
 
 
206 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  37.5 
 
 
214 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  35.29 
 
 
208 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  45.45 
 
 
196 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  36.51 
 
 
211 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  41.38 
 
 
198 aa  47  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0248  SirA family protein  31.67 
 
 
203 aa  46.2  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  30.51 
 
 
190 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  30.51 
 
 
190 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2466  hypothetical protein  42.86 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315359  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  47.17 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  27.94 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  39.22 
 
 
209 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  36.36 
 
 
196 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  33.33 
 
 
195 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  31.03 
 
 
189 aa  43.5  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2083  SirA family protein  28.95 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11340  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  35.94 
 
 
203 aa  43.5  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.544302  normal  0.497017 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  32.84 
 
 
204 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  39.22 
 
 
200 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  28.57 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1417  hypothetical protein  31.88 
 
 
212 aa  42  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.126908  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0027  SirA family protein  39.62 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  23.94 
 
 
80 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  36.51 
 
 
77 aa  41.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0677  hypothetical protein  34.85 
 
 
197 aa  41.6  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  25.76 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  30.43 
 
 
200 aa  41.2  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  31.82 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  31.82 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  30.3 
 
 
75 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  31.82 
 
 
75 aa  40.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  26.15 
 
 
80 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  26.15 
 
 
80 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.101058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>