More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3148 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 250 aa  513  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  68.28 
 
 		 236 aa  330  9e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  33.81 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  36.7 
 
 		 227 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  34.4 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.11 
 
 		 239 aa  119  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 		 228 aa  108  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 227 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 230 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 223 aa  105  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  29.47 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 231 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 234 aa  102  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 229 aa  99.8  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2218  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 268 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  31.19 
 
 		 227 aa  98.2  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1988  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0497005  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  29.26 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3247  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 230 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  35.2 
 
 		 216 aa  95.1  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 227 aa  95.1  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  29.86 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  32.81 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 217 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 227 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  30.93 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 245 aa  92.8  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 231 aa  92.8  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1773  transcriptional regulator, GntR family  28.19 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.851704  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6117  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 248 aa  92  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 232 aa  92  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 234 aa  92  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 235 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 		 221 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 267 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4561  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 232 aa  89.7  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  30.06 
 
 		 229 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 216 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  29.56 
 
 		 226 aa  90.1  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1158  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 227 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.48 
 
 		 229 aa  89.7  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 226 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 218 aa  89.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  28.3 
 
 		 241 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 223 aa  89  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1379  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 227 aa  89  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1061  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 227 aa  89  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1218  GntR domain-containing protein  31.96 
 
 		 250 aa  89  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 249 aa  89  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 226 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 224 aa  88.6  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 224 aa  88.6  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  26.19 
 
 		 215 aa  88.6  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6111  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 214 aa  88.2  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>