More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3109 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3109  sensor protein  100 
 
 		 485 aa  987    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 641 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 640 aa  196  1e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 639 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 639 aa  188  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 488 aa  183  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 639 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 620 aa  179  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 		 473 aa  179  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 		 581 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 885 aa  173  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2811  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 829 aa  172  7.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0857  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 		 698 aa  170  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0897898 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 		 1010 aa  170  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 634 aa  170  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 612 aa  169  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 458 aa  169  8e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 718 aa  169  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.149473  decreased coverage  0.00105308 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 		 827 aa  169  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 677 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 		 453 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  36.64 
 
 		 617 aa  167  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 614 aa  166  9e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.68 
 
 		 933 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  37.71 
 
 		 461 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  37.71 
 
 		 461 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 		 571 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 		 489 aa  164  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  37.29 
 
 		 461 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 722 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 		 493 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 592 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 470 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 596 aa  160  4e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 		 944 aa  160  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1099  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 430 aa  160  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000024984 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 905 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  37.55 
 
 		 581 aa  159  9e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 467 aa  159  9e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 719 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.688425  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 3470 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  38.14 
 
 		 464 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 1043 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  37.99 
 
 		 581 aa  159  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  33.21 
 
 		 470 aa  159  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 471 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 625 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  32.73 
 
 		 473 aa  157  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2189  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 729 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.49015  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.84 
 
 		 1002 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 711 aa  157  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 614 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 646 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  34.2 
 
 		 810 aa  156  6e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 911 aa  156  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0985  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 		 597 aa  156  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0752971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3611  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 566 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.716129  hitchhiker  0.000346414 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 593 aa  155  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1742  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 608 aa  155  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 612 aa  155  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 473 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 1017 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 568 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 		 587 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  27.81 
 
 		 1133 aa  154  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4365  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 514 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108097  normal  0.083954 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 754 aa  153  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 452 aa  153  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 958 aa  153  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 375 aa  153  8e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0996  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 396 aa  152  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 880 aa  152  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 524 aa  153  8.999999999999999e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  38.56 
 
 		 903 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 1629 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  26.72 
 
 		 508 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2278  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 729 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  33.01 
 
 		 508 aa  152  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1644  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 597 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 884 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1668  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 730 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423858  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 919 aa  152  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 1060 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 610 aa  151  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 		 584 aa  152  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 2161 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 504 aa  152  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 471 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  35.16 
 
 		 537 aa  151  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3817  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 392 aa  151  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.59485  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.53 
 
 		 1363 aa  151  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  36.32 
 
 		 913 aa  151  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  38.14 
 
 		 927 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.34 
 
 		 1162 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  33.44 
 
 		 661 aa  150  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 2153 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  30.82 
 
 		 363 aa  150  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>