More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3087 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3087  amidohydrolase  100 
 
 		 424 aa  856    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000127453 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1275  amidohydrolase  36.99 
 
 		 399 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2239  S-adenosylhomocysteine deaminase  36.29 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.975396 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2963  amidohydrolase family protein  38.02 
 
 		 468 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3409  amidohydrolase  33.67 
 
 		 428 aa  172  7.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00196752  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2081  amidohydrolase  31.57 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515321  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1708  Atz/Trz family chlorohydrolase  33.1 
 
 		 420 aa  171  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0266273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1241  amidohydrolase  31.03 
 
 		 414 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29686e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3009  amidohydrolase  30.52 
 
 		 414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1645  Atz/Trz family chlorohydrolase  32.44 
 
 		 421 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0024  amidohydrolase  36.33 
 
 		 299 aa  154  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0252  amidohydrolase  35.64 
 
 		 368 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00951952  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1827  cytosine deaminase/metal-dependent hydrolase  32.55 
 
 		 428 aa  143  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0600638  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0465  amidohydrolase  34.36 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.742317  normal  0.0452938 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1874  amidohydrolase  35.33 
 
 		 432 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1424  amidohydrolase  40.82 
 
 		 478 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0961  amidohydrolase  30.58 
 
 		 413 aa  130  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2834  amidohydrolase  26.7 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11770  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  30.81 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1825  amidohydrolase  33.02 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.629302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1971  amidohydrolase  31.59 
 
 		 416 aa  119  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0576  amidohydrolase  32.11 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4208  amidohydrolase  31.55 
 
 		 416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00909299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01530  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  27.32 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.904881  normal  0.929171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3845  amidohydrolase  28.8 
 
 		 392 aa  110  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1743  S-adenosylhomocysteine deaminase  27.46 
 
 		 373 aa  104  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0289  amidohydrolase  26.98 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8056  amidohydrolase  27.93 
 
 		 428 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0686  chlorohydrolase  25.23 
 
 		 408 aa  99  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.777216  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0229  chlorohydrolase  24.93 
 
 		 407 aa  99  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1532  putative exported amidohydrolase  23.38 
 
 		 462 aa  97.8  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241269  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  26.37 
 
 		 431 aa  97.4  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.5 
 
 		 484 aa  97.8  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.5 
 
 		 451 aa  97.4  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0370  amidohydrolase 1  31.7 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1212  chlorohydrolase  25.15 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.02 
 
 		 439 aa  94.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2404  amidohydrolase  27.01 
 
 		 432 aa  94.4  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.378859  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3188  amidohydrolase  29.91 
 
 		 598 aa  94.4  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.862249  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1915  amidohydrolase  27.42 
 
 		 421 aa  94  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232567  normal  0.102109 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0398  amidohydrolase  31.91 
 
 		 412 aa  93.6  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.535979  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0399  amidohydrolase  32.24 
 
 		 412 aa  93.2  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.408969  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5431  chlorohydrolase  31.27 
 
 		 466 aa  93.2  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225763  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0441  amidohydrolase  26.27 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  28.39 
 
 		 440 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  27.18 
 
 		 439 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.15 
 
 		 444 aa  92  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  27.17 
 
 		 433 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  26.48 
 
 		 458 aa  92  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  24.29 
 
 		 431 aa  90.9  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0873  cytosine deaminase  24.77 
 
 		 457 aa  90.5  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.291965  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1504  chlorohydrolase  25 
 
 		 406 aa  89.7  8e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0064  chlorohydrolase  25.57 
 
 		 409 aa  89.7  9e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  27.65 
 
 		 428 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.92 
 
 		 442 aa  88.6  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  26.94 
 
 		 431 aa  87.4  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  26.46 
 
 		 430 aa  87.4  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1577  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.89 
 
 		 455 aa  86.7  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0236916  unclonable  0.000000239085 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  27.22 
 
 		 431 aa  86.7  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2295  N-ethylammeline chlorohydrolase  26 
 
 		 442 aa  86.7  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.853343  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  27.05 
 
 		 447 aa  86.3  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0077  chlorohydrolase  25.24 
 
 		 409 aa  86.3  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1688  amidohydrolase  28.22 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.126758 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1707  chlorohydrolase  25.53 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1681  chlorohydrolase  25.53 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00472799  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  27.83 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2038  amidohydrolase  27.78 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984083  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  27.57 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0105  chlorohydrolase  24.92 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1515  amidohydrolase  29.25 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  25.26 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00380  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.38 
 
 		 449 aa  83.6  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280018  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  24.56 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0991  amidohydrolase  26.3 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  26.94 
 
 		 656 aa  83.2  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3205  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.34 
 
 		 461 aa  83.2  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  25 
 
 		 435 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  25 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0042  amidohydrolase  26.82 
 
 		 426 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1486  amidohydrolase  25.66 
 
 		 435 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1865  chlorohydrolase  25 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967163  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  25 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1903  chlorohydrolase  25 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  24.28 
 
 		 432 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7024  amidohydrolase  27.88 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  27.55 
 
 		 432 aa  82  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0977  amidohydrolase  21.95 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.588063  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  28.53 
 
 		 442 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2226  amidohydrolase  27.4 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.306812 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0362  chlorohydrolase  26.69 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0746699  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  26.88 
 
 		 663 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1460  chlorohydrolase  25.36 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00231906  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  25.06 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1721  chlorohydrolase  25 
 
 		 441 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  27.51 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1931  amidohydrolase  27.46 
 
 		 440 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  24.74 
 
 		 435 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1273  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.21 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2838  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.48 
 
 		 458 aa  79.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0556  amidohydrolase  25.42 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.216303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>