37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3079 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3079  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  729    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000578583  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0046  hypothetical protein  44.83 
 
 		 356 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0492  hypothetical protein  37.46 
 
 		 343 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.894917  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0516  hypothetical protein  35.57 
 
 		 342 aa  219  6e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_457  hypothetical protein, methionine synthase II-like protein  35.28 
 
 		 342 aa  219  6e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2318  hypothetical protein  34.76 
 
 		 357 aa  203  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026475  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1450  hypothetical protein  34.27 
 
 		 361 aa  202  9e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000825715  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0833  hypothetical protein  35.14 
 
 		 355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.637029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2940  hypothetical protein  34.93 
 
 		 355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0730629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1037  hypothetical protein  32.21 
 
 		 354 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0203  hypothetical protein  33.24 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0807  hypothetical protein  29.14 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1192  hypothetical protein  29.33 
 
 		 346 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0456752 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1397  hypothetical protein  27.17 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00537849  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0486  hypothetical protein  26.42 
 
 		 346 aa  116  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0157  hypothetical protein  26.1 
 
 		 346 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.050651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1610  hypothetical protein  25.58 
 
 		 342 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.589994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1905  hypothetical protein  25.31 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000983777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3098  hypothetical protein  27.81 
 
 		 358 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3561  hypothetical protein  22.86 
 
 		 353 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2350  hypothetical protein  21.9 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185233  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2108  methionine synthase, vitamin-B12 independent  30.45 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.368656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1445  Methionine synthase vitamin-B12 independent  24.86 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.354895 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1312  Methionine synthase vitamin-B12 independent  24.37 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.558991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1858  methionine synthase, vitamin-B12 independent  28.87 
 
 		 336 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1924  methionine synthase, vitamin-B12 independent  28.87 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261497  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1878  methionine synthase, vitamin-B12 independent  28.87 
 
 		 339 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2908  Methionine synthase vitamin-B12 independent  25.68 
 
 		 335 aa  50.1  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0602  hypothetical protein  21.33 
 
 		 342 aa  50.1  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.441061  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4087  Methionine synthase vitamin-B12 independent  26.56 
 
 		 345 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08670  cobalamin-independent methionine synthase  23.8 
 
 		 362 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0159  Methionine synthase vitamin-B12 independent  21.83 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3565  Methionine synthase vitamin-B12 independent  23.41 
 
 		 337 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0908729  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4252  methionine synthase, vitamin-B12 independent  24.58 
 
 		 336 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3253  Methionine synthase vitamin-B12 independent  26.07 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1722  hypothetical protein  27.78 
 
 		 311 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135438  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3648  methionine synthase, vitamin-B12 independent  23.18 
 
 		 376 aa  43.9  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.744365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>