More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3063 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
438 aa  890    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  57.05 
 
 
443 aa  487  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  56.06 
 
 
443 aa  481  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  57.87 
 
 
444 aa  476  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  56.22 
 
 
452 aa  476  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  56.65 
 
 
444 aa  473  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  56.06 
 
 
444 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  55.3 
 
 
455 aa  464  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  56.36 
 
 
441 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  50.98 
 
 
461 aa  426  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  51.22 
 
 
450 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  51.08 
 
 
457 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  52.04 
 
 
444 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  53.63 
 
 
439 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  52.5 
 
 
441 aa  402  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  50.89 
 
 
432 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  51.8 
 
 
458 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  48.42 
 
 
446 aa  391  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  50.76 
 
 
438 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  51.21 
 
 
456 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  50.87 
 
 
439 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  49.75 
 
 
422 aa  388  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  50.38 
 
 
439 aa  386  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  47.85 
 
 
451 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  50.75 
 
 
453 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  48.47 
 
 
444 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  50.48 
 
 
468 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  49.06 
 
 
428 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  48.07 
 
 
468 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  46.97 
 
 
476 aa  381  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  46.58 
 
 
458 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  50.63 
 
 
445 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  51.64 
 
 
440 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  48.57 
 
 
442 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  49.62 
 
 
440 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  47.56 
 
 
428 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  53.64 
 
 
483 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  50.63 
 
 
424 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  50.37 
 
 
433 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  50.38 
 
 
436 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  50.63 
 
 
424 aa  372  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  49.87 
 
 
439 aa  375  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  45.61 
 
 
455 aa  373  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  49.88 
 
 
429 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  45.79 
 
 
456 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  50.38 
 
 
436 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  50.13 
 
 
440 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  51.15 
 
 
438 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  50.63 
 
 
438 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  47.71 
 
 
481 aa  368  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  45.79 
 
 
457 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  47.26 
 
 
423 aa  369  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  47.28 
 
 
451 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  51.15 
 
 
438 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  48.18 
 
 
426 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  50.38 
 
 
440 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  49.87 
 
 
437 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  54.91 
 
 
445 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  44.98 
 
 
480 aa  366  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  46.64 
 
 
446 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  50.88 
 
 
440 aa  368  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  50.88 
 
 
440 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  45.5 
 
 
452 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  48.03 
 
 
423 aa  364  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  47.75 
 
 
444 aa  363  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  54.13 
 
 
482 aa  361  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  54.13 
 
 
482 aa  361  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  49.74 
 
 
445 aa  360  4e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  49.74 
 
 
445 aa  360  4e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  45.87 
 
 
443 aa  359  6e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  51.1 
 
 
410 aa  359  7e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  45.73 
 
 
471 aa  357  1.9999999999999998e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  47.22 
 
 
440 aa  356  5e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  46.21 
 
 
444 aa  355  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  47.92 
 
 
440 aa  354  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  47.11 
 
 
440 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  46.8 
 
 
440 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  46.45 
 
 
434 aa  352  8.999999999999999e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  42.49 
 
 
462 aa  350  2e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  47.41 
 
 
456 aa  351  2e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  47.16 
 
 
456 aa  350  4e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  53.27 
 
 
444 aa  349  6e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  47.36 
 
 
445 aa  348  1e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  46.88 
 
 
447 aa  345  8e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  45.88 
 
 
439 aa  344  2e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  43.65 
 
 
445 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  43.39 
 
 
448 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  43.26 
 
 
448 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  46.56 
 
 
441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  51.61 
 
 
415 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  42.09 
 
 
435 aa  337  2.9999999999999997e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  43.19 
 
 
439 aa  335  7e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  40.92 
 
 
434 aa  334  2e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  45.43 
 
 
449 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  47.61 
 
 
445 aa  328  8e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  45.86 
 
 
437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0848  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  41.55 
 
 
419 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0053756  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  45.61 
 
 
437 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  45.64 
 
 
462 aa  326  5e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  46.38 
 
 
530 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>