81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3053 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3011  peptidase M28  100 
 
 		 325 aa  672    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844179  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3053  peptidase M28  100 
 
 		 325 aa  672    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.387481 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3437  peptidase M28  62.31 
 
 		 453 aa  401  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160047 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1386  peptidase M28  44.94 
 
 		 323 aa  285  8e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492148  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2420  M28A family peptidase  44.94 
 
 		 323 aa  285  8e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.564351  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2428  M28 family peptidase  50.19 
 
 		 273 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3438  peptidase M28  50.7 
 
 		 321 aa  255  7e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.346638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  40.29 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  41.01 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  37.59 
 
 		 347 aa  190  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1307  peptidase M28  38.38 
 
 		 299 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0681394  normal  0.0392161 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0187  peptidase M28  31.64 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  35.16 
 
 		 282 aa  142  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1467  peptidase M28  31.39 
 
 		 305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1044  peptidase M28  34.64 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202745 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3219  peptidase M28  32.21 
 
 		 306 aa  119  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.115329  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  30.41 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  28.57 
 
 		 333 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0019  hypothetical protein  29.17 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  24.51 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  28.27 
 
 		 775 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0032  hypothetical protein  26.67 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  38.71 
 
 		 436 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0031  hypothetical protein  26.67 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1748  peptidase M28  22.14 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  29.02 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  28.19 
 
 		 512 aa  57  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  26.19 
 
 		 440 aa  57  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  37.78 
 
 		 454 aa  57  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  28.16 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  33.07 
 
 		 1247 aa  55.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  25.42 
 
 		 1103 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  29.31 
 
 		 591 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  25.45 
 
 		 322 aa  53.5  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  32.46 
 
 		 1147 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  33.33 
 
 		 456 aa  53.1  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0003  peptidase M28  31.79 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  34.44 
 
 		 440 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  33.33 
 
 		 438 aa  52.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  33.13 
 
 		 430 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  28.99 
 
 		 568 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  34.04 
 
 		 1077 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  35.53 
 
 		 457 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  29.49 
 
 		 502 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  35.23 
 
 		 463 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1664  peptidase M28  29.81 
 
 		 479 aa  48.5  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  25.65 
 
 		 407 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  26.69 
 
 		 677 aa  48.5  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  33.33 
 
 		 457 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  27.59 
 
 		 947 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  28.93 
 
 		 437 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  31.91 
 
 		 466 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  23.77 
 
 		 323 aa  47.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  33.7 
 
 		 459 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  32.98 
 
 		 465 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  26.29 
 
 		 315 aa  46.2  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  31.19 
 
 		 466 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  30.77 
 
 		 466 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3374  hypothetical protein  22.78 
 
 		 476 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0508877  normal  0.0110235 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  31.19 
 
 		 466 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  30.97 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  31.19 
 
 		 466 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  31.19 
 
 		 466 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  30.77 
 
 		 466 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  33.98 
 
 		 647 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  30 
 
 		 447 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  29.67 
 
 		 466 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0856  peptidase M28  31.16 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  33.98 
 
 		 647 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  30.28 
 
 		 466 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  20.83 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  30.49 
 
 		 312 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0141  Aminopeptidase Y  38.64 
 
 		 506 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  29.81 
 
 		 466 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  22.73 
 
 		 487 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  32.21 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  29.09 
 
 		 373 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  32.43 
 
 		 309 aa  43.1  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  23.86 
 
 		 483 aa  42.7  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3904  peptidase M28  31.48 
 
 		 344 aa  42.4  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.581158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  33.7 
 
 		 391 aa  42.4  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>