More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3025 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2983  acetolactate synthase, small subunit  100 
 
 
166 aa  332  1e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00470165  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3025  acetolactate synthase, small subunit  100 
 
 
166 aa  332  1e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.897404  normal  0.20881 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1909  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  58.02 
 
 
168 aa  191  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1910  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.96 
 
 
163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.370159  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2038  acetolactate synthase, small subunit  57.69 
 
 
166 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.96 
 
 
163 aa  186  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.512898  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.59 
 
 
163 aa  186  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000850238  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1261  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.96 
 
 
163 aa  185  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105007  hitchhiker  0.000000415778 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2167  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.69 
 
 
163 aa  183  9e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.998104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2557  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.59 
 
 
163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0881819  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1496  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.96 
 
 
163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.33 
 
 
163 aa  181  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0154  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.7 
 
 
163 aa  179  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122247 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1661  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.85 
 
 
162 aa  177  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2556  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.37 
 
 
165 aa  177  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.080772  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0224  acetolactate synthase, small subunit  53.8 
 
 
164 aa  177  7e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.708645  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1904  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.5 
 
 
163 aa  177  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0409  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.13 
 
 
162 aa  175  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1691  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  58.97 
 
 
162 aa  175  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0709  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.53 
 
 
161 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
163 aa  170  9e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0122567  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0219  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.53 
 
 
161 aa  169  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.680597  normal  0.0364419 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0111  acetolactate synthase, small subunit  50 
 
 
165 aa  168  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.849988  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0503  acetolactate synthase, small subunit  50 
 
 
170 aa  167  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.723319  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0899  acetolactate synthase, small subunit  50.63 
 
 
167 aa  167  7e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2896  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.92 
 
 
171 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.386622  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.37 
 
 
172 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000214698  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.38 
 
 
164 aa  164  5.9999999999999996e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217032 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0230  acetolactate synthase, small subunit  50.96 
 
 
187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  8.09057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.37 
 
 
170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1071  acetolactate synthase, small subunit  51.9 
 
 
167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00570032  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0591  acetolactate synthase, small subunit  49.68 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000221035  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3481  acetolactate synthase, small subunit  50.97 
 
 
156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.171656  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2400  acetolactate synthase, small subunit  51.9 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2257  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.73 
 
 
172 aa  162  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1320  acetolactate synthase, small subunit  46.84 
 
 
163 aa  160  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2271  acetolactate synthase, small subunit  46.2 
 
 
163 aa  159  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3436  acetolactate synthase, small subunit  47.8 
 
 
169 aa  159  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00183335  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0473  acetolactate synthase, small subunit  47.47 
 
 
163 aa  159  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.990351  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3616  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.03 
 
 
164 aa  158  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178252  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.47 
 
 
163 aa  158  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000667629  hitchhiker  0.0000555489 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2318  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.57 
 
 
163 aa  158  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.342254  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2145  acetolactate synthase, small subunit  47.17 
 
 
160 aa  157  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.168594  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1904  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.57 
 
 
163 aa  157  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2104  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.2 
 
 
163 aa  157  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.111178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2227  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.57 
 
 
163 aa  157  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.469114 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2157  acetolactate synthase, small subunit  48.39 
 
 
163 aa  157  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0353  acetolactate synthase, small subunit  48.1 
 
 
165 aa  157  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0606  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.96 
 
 
167 aa  157  7e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.211278 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0883  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.2 
 
 
163 aa  157  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0737902  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0893  acetolactate synthase, small subunit  44.3 
 
 
163 aa  157  9e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.254483  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0746  acetolactate synthase, small subunit  44.3 
 
 
161 aa  157  9e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2076  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.94 
 
 
163 aa  156  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42510  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.2 
 
 
163 aa  156  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0694  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.62 
 
 
164 aa  156  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1241  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.61 
 
 
167 aa  156  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0418826 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0912  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.57 
 
 
163 aa  156  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2120  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.3 
 
 
163 aa  155  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.596226  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2517  acetolactate synthase, small subunit  44.94 
 
 
170 aa  155  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000223689  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5409  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.2 
 
 
163 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0780093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62150  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.2 
 
 
163 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0299879 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4866  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.94 
 
 
163 aa  155  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1718  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.3 
 
 
163 aa  155  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0129853  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4787  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.94 
 
 
163 aa  154  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0258419  hitchhiker  0.00663707 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08880  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.13 
 
 
168 aa  154  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0982  acetolactate synthase, small subunit  44.94 
 
 
163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0847  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.94 
 
 
163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397528 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0948  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.94 
 
 
163 aa  154  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2035  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.77 
 
 
182 aa  154  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403996 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4679  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.3 
 
 
163 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0442115 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0755  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.3 
 
 
163 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100684  hitchhiker  0.000000273125 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1444  acetolactate synthase, small subunit  49.37 
 
 
167 aa  154  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  hitchhiker  0.00470003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4677  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.3 
 
 
163 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  hitchhiker  0.00000000335837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.3 
 
 
163 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0246688  hitchhiker  0.000231458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3111  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.3 
 
 
163 aa  154  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00654911  normal  0.734672 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.74 
 
 
175 aa  153  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1954  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.54 
 
 
164 aa  153  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0934233 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1901  acetolactate synthase, small subunit  46.84 
 
 
166 aa  153  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0148095  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1007  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.3 
 
 
163 aa  153  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  hitchhiker  0.00000000512539 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1781  acetolactate synthase, small subunit  46.79 
 
 
164 aa  153  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0752076 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2519  acetolactate synthase small subunit  45.91 
 
 
164 aa  152  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2369  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.67 
 
 
163 aa  152  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1952  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.3 
 
 
163 aa  152  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1770  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.3 
 
 
163 aa  152  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488316  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6085  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.15 
 
 
180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2892  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.3 
 
 
163 aa  152  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.018126 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1329  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.2 
 
 
163 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0874  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.69 
 
 
186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271515  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.1 
 
 
172 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2021  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.2 
 
 
163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2483  acetolactate synthase, small subunit  46.1 
 
 
159 aa  151  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1972  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.54 
 
 
164 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0607984  hitchhiker  0.0000404141 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2387  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.54 
 
 
164 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474277  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3230  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.57 
 
 
163 aa  151  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88024  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2491  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.54 
 
 
164 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126247  hitchhiker  0.000727987 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2375  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.54 
 
 
164 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0991612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2980  acetolactate synthase, small subunit  46.2 
 
 
172 aa  151  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0119022  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3022  acetolactate synthase, small subunit  46.2 
 
 
172 aa  151  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0809645  normal  0.107141 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0397  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.94 
 
 
163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458686  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1275  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.94 
 
 
163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>