86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3007 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 789 aa  1627    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 789 aa  1627    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1633  hypothetical protein  34.9 
 
 		 619 aa  260  8e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1431  hypothetical protein  33.13 
 
 		 608 aa  243  7.999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000524764  normal  0.16673 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  32.52 
 
 		 760 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  29.2 
 
 		 1112 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  29.2 
 
 		 1070 aa  122  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  29.2 
 
 		 1070 aa  122  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  30.89 
 
 		 779 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  30.89 
 
 		 765 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  30.89 
 
 		 760 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  31.3 
 
 		 772 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  30.49 
 
 		 766 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  30.49 
 
 		 766 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  30.08 
 
 		 755 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  29.52 
 
 		 995 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  32.52 
 
 		 542 aa  115  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  29.59 
 
 		 772 aa  114  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  35.78 
 
 		 341 aa  114  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  36.67 
 
 		 1085 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  29.07 
 
 		 1088 aa  109  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  24.93 
 
 		 1052 aa  108  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  35.5 
 
 		 347 aa  107  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  30.45 
 
 		 1351 aa  107  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  33.82 
 
 		 1266 aa  104  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  29.69 
 
 		 994 aa  104  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  29.67 
 
 		 1012 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  29.69 
 
 		 993 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  26.04 
 
 		 531 aa  100  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  28.33 
 
 		 643 aa  100  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  29.8 
 
 		 1011 aa  100  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  29.87 
 
 		 954 aa  99.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  29.18 
 
 		 284 aa  96.3  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  33.82 
 
 		 348 aa  87.8  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  33.82 
 
 		 348 aa  87.8  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  30.26 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  30.52 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  33.65 
 
 		 498 aa  82.8  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  28.7 
 
 		 858 aa  81.3  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  28.14 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  27.81 
 
 		 399 aa  77.4  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  32.67 
 
 		 384 aa  73.2  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  25 
 
 		 399 aa  73.2  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3230  hypothetical protein  29.89 
 
 		 718 aa  71.2  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00921587  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  29.56 
 
 		 467 aa  70.1  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  31.28 
 
 		 692 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  26.61 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  27.5 
 
 		 587 aa  69.3  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1551  leucine-rich repeat protein  30.69 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  31.51 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  36.03 
 
 		 637 aa  67.4  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  25.82 
 
 		 565 aa  66.2  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  32.19 
 
 		 197 aa  65.5  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.84 
 
 		 1107 aa  64.7  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  29.28 
 
 		 877 aa  64.3  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  24.28 
 
 		 539 aa  63.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  27.16 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02459  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10390)  30 
 
 		 1780 aa  61.2  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.186892 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  31.18 
 
 		 892 aa  60.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28748  predicted protein  29.31 
 
 		 935 aa  60.8  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73960  predicted protein  30.4 
 
 		 1335 aa  59.7  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.847897 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  29.59 
 
 		 1231 aa  59.7  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  43.82 
 
 		 2294 aa  58.5  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1045  hypothetical protein  31.58 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0229946 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1193  internalin-related protein  28.07 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0638484  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1060  leucine-rich repeat protein  31.91 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  24.76 
 
 		 863 aa  57.4  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0527  hypothetical protein  29.68 
 
 		 312 aa  56.6  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2048  glycoprotein  24.06 
 
 		 528 aa  56.2  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  29.9 
 
 		 1041 aa  54.7  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  27.95 
 
 		 867 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  21.81 
 
 		 535 aa  51.6  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03490  leucine repeat containing protein, putative  25.34 
 
 		 765 aa  52  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2687  peptidase domain-containing protein  24.15 
 
 		 747 aa  51.2  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0752  hypothetical protein  29.25 
 
 		 600 aa  50.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  31.73 
 
 		 354 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35741  predicted protein  28.79 
 
 		 1370 aa  49.3  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  30 
 
 		 242 aa  47.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  30.26 
 
 		 1744 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  28.26 
 
 		 1290 aa  47.8  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3929  hypothetical protein  34.34 
 
 		 449 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0885912 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  23.64 
 
 		 1749 aa  46.6  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  30.57 
 
 		 1376 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  28.64 
 
 		 1263 aa  45.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  29.63 
 
 		 508 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0062  alpha-L-arabinofuranosidase B  24.27 
 
 		 854 aa  44.3  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.649597  normal  0.531326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>