17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2900 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2900  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  226  7e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0226178 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0681  ISCpe7, transposase  35.06 
 
 
340 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0784  ISCpe7, transposase  35.06 
 
 
340 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.653929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0802  ISCpe7, transposase  35.06 
 
 
340 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0691516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0809  ISCpe7, transposase  35.06 
 
 
340 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.313897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0947  ISCpe7, transposase  35.06 
 
 
340 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0680749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0982  ISCpe7, transposase  35.06 
 
 
340 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1313  ISCpe7, transposase  35.06 
 
 
340 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0190357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1537  ISCpe7, transposase  33.77 
 
 
340 aa  55.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.10688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0635  ISCpe7, transposase  35.06 
 
 
186 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1473  ISCpe7, transposase  35.06 
 
 
253 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.804077  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0929  ISCpe7, transposase  35.06 
 
 
186 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0298408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1189  ISCpe7, transposase  33.77 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238866  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0990  DNA topoisomerase III  50 
 
 
671 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.585612  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0755  integrase catalytic subunit  31.65 
 
 
343 aa  43.9  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000147635  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2233  DNA topoisomerase III  47.37 
 
 
671 aa  43.9  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0145948  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2342  DNA topoisomerase III  44.74 
 
 
671 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>