49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2728 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2728  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  280  3e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.21951  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1392  hypothetical protein  55.94 
 
 
143 aa  147  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1680  hypothetical protein  52.45 
 
 
143 aa  132  1e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0988  protein of unknown function DUF101  48.95 
 
 
143 aa  126  1e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1615  hypothetical protein  52.45 
 
 
143 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.307554  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3272  protein of unknown function DUF101  48.25 
 
 
143 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2143  hypothetical protein  46.85 
 
 
143 aa  109  2e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.706789  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1251  archease family protein  34.48 
 
 
146 aa  80.9  5e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0242  hypothetical protein  32.62 
 
 
138 aa  79.7  1e-14  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0957  archease family protein  32.62 
 
 
138 aa  77  8e-14  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.395937  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1671  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  76.6  1e-13  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.532408  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1373  hypothetical protein  33.79 
 
 
141 aa  72.4  2e-12  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0129  hypothetical protein  32.88 
 
 
144 aa  70.9  6e-12  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.011827  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1747  protein of unknown function DUF101  29.58 
 
 
139 aa  70.5  8e-12  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2208  archease family protein  39.86 
 
 
146 aa  68.2  3e-11  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  1.44175e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0271  hypothetical protein  32.84 
 
 
165 aa  67.4  7e-11  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1546  hypothetical protein  29.37 
 
 
140 aa  67  8e-11  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0121  hypothetical protein  32.87 
 
 
135 aa  66.2  1e-10  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  1.565e-07  hitchhiker  4.15863e-05 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1264  protein of unknown function DUF101  32.39 
 
 
138 aa  66.2  1e-10  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0569  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  64.7  4e-10  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0655  protein of unknown function DUF101  32.84 
 
 
143 aa  64.7  4e-10  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1831  hypothetical protein  34.97 
 
 
150 aa  64.3  6e-10  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  5.7693e-05  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1949  protein of unknown function DUF101  35.34 
 
 
141 aa  63.5  9e-10  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  9.3626e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0707  hypothetical protein  32.59 
 
 
147 aa  62  2e-09  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1652  hypothetical protein  31.47 
 
 
135 aa  62.4  2e-09  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1793  hypothetical protein  32.87 
 
 
135 aa  58.9  2e-08  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1078  protein of unknown function DUF101  30.83 
 
 
139 aa  56.6  1e-07  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1685  hypothetical protein  29.1 
 
 
147 aa  55.5  2e-07  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0257186 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2152  hypothetical protein  29.55 
 
 
147 aa  53.9  8e-07  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0196  hypothetical protein  29.58 
 
 
143 aa  52  3e-06  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30479  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2756  protein of unknown function DUF101  30.83 
 
 
136 aa  51.6  4e-06  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.905523  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2126  hypothetical protein  29.25 
 
 
110 aa  50.8  6e-06  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_726  hypothetical protein  29.41 
 
 
138 aa  50.8  6e-06  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3853  hypothetical protein  28.67 
 
 
138 aa  49.3  2e-05  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1580  hypothetical protein  28.06 
 
 
143 aa  48.1  4e-05  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.986242  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0479  hypothetical protein  30.6 
 
 
138 aa  47.8  5e-05  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.541748  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0741  hypothetical protein  28.99 
 
 
138 aa  47.4  8e-05  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0232  hypothetical protein  28.57 
 
 
138 aa  47  9e-05  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0688  hypothetical protein  32.87 
 
 
150 aa  47  9e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0414002  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0822  hypothetical protein  26.67 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.303013  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0018  hypothetical protein  30.08 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.4858e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2562  protein of unknown function DUF101  35.76 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46270  hypothetical protein  36.08 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0332  protein of unknown function DUF101  24.24 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0902  hypothetical protein  28.03 
 
 
163 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0987  hypothetical protein  30 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0947  hypothetical protein  38.75 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2022  protein of unknown function DUF101  30.57 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.367905 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1005  protein of unknown function DUF101  30.61 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>