More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2727 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2727  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 		 298 aa  597  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.081954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2838  cobalamin synthesis protein P47K  28.53 
 
 		 356 aa  139  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  30.35 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  31.85 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1786  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.57 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114166  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  30.92 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  31.99 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  30.92 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1925  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.57 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000812691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1961  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.25 
 
 		 307 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000478714 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2009  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.77 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  32.94 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  30.92 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1765  GTPase  30.25 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  30.99 
 
 		 366 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  32.43 
 
 		 361 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1485  cobalamin synthesis protein P47K  28.38 
 
 		 310 aa  132  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861962  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  40.76 
 
 		 355 aa  132  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  33.54 
 
 		 328 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  33.54 
 
 		 328 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  33.55 
 
 		 320 aa  132  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1743  GTPase  29.94 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180746  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  32.36 
 
 		 349 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2030  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.02 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167135  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  31.49 
 
 		 350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  33.44 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  32.9 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1930  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.98 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  32.06 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3150  cobalamin synthesis protein P47K  30.03 
 
 		 640 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179732  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.28 
 
 		 316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  29.56 
 
 		 319 aa  129  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  33.02 
 
 		 329 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.28 
 
 		 316 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  39.67 
 
 		 353 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3412  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.98 
 
 		 307 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  31.13 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  30.72 
 
 		 364 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  30.77 
 
 		 349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  30.46 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  31.23 
 
 		 353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4358  cobalamin synthesis protein P47K  32.58 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  31.05 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  30.87 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  30.09 
 
 		 362 aa  126  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  32.62 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.76 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  30 
 
 		 342 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  39.78 
 
 		 363 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6702  putative cobalamin synthesis protein cobW  31.01 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203286  normal  0.120205 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.72 
 
 		 316 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.82 
 
 		 316 aa  126  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30 
 
 		 319 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  28.66 
 
 		 338 aa  125  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.16 
 
 		 316 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.16 
 
 		 316 aa  125  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  28.53 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  29.79 
 
 		 362 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3403  cobalamin synthesis protein P47K  31.73 
 
 		 341 aa  123  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  29.34 
 
 		 404 aa  123  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  30.03 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  32.67 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  30.82 
 
 		 349 aa  122  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  32.68 
 
 		 336 aa  122  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  29.54 
 
 		 344 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  33.96 
 
 		 332 aa  122  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3612  cobalamin synthesis protein, P47K  31.54 
 
 		 624 aa  122  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  30.9 
 
 		 323 aa  122  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  31.03 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  38.1 
 
 		 358 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  39.51 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  27.88 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  33.97 
 
 		 322 aa  119  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  30.03 
 
 		 384 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  31.72 
 
 		 324 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0917  cobalamin synthesis protein P47K  28.47 
 
 		 614 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  27.96 
 
 		 349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  38.65 
 
 		 369 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  31.72 
 
 		 339 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  29.85 
 
 		 378 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3251  cobalamin synthesis protein, P47K  31.8 
 
 		 290 aa  115  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.784399  normal  0.367551 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  38.86 
 
 		 365 aa  115  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  30.63 
 
 		 394 aa  114  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  30.54 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  29.97 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  29.85 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  33.8 
 
 		 493 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  40 
 
 		 393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  29.05 
 
 		 346 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  35.75 
 
 		 357 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  40.54 
 
 		 343 aa  113  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0123  cobalamin synthesis protein, P47K  29.67 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.54 
 
 		 374 aa  113  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0508  cobalamin synthesis protein, P47K  33.1 
 
 		 648 aa  112  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0182  cobalamin synthesis protein P47K  28 
 
 		 308 aa  112  6e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1027  cobalamin biosynthesis protein CobW  28.37 
 
 		 348 aa  112  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.959481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  39.13 
 
 		 354 aa  112  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1028  cobalamin synthesis protein P47K  32.71 
 
 		 322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.906843  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  38.46 
 
 		 379 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5224  cobalamin synthesis protein, P47K  30.45 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>