23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2717 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2717  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  324  3e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2717  hypothetical protein  43.42 
 
 
151 aa  114  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0011  hydrogenase maturation protease  34.23 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0013  hydrogenase maturation protease  34.23 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4493  hydrogenase maturation protease  36.24 
 
 
151 aa  84.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3538  hypothetical protein  42.31 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0079  hydrogenase maturation protease  31.76 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.882887  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4665  hypothetical protein  35.07 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4247  hydrogenase maturation protease  36.92 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2554  hypothetical protein  37.12 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.165189  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2794  hypothetical protein  40.46 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2862  hypothetical protein  36.64 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3043  hydrogenase maturation protease  38.17 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605484  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2949  hydrogenase maturation protease  38.17 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109087  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1555  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.85 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.0326576 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1369  hypothetical protein  32.43 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5168  hydrogenase maturation protease  30.3 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.234349 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2475  hydrogenase maturation protease  39.34 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0113  HoxW protein  30.14 
 
 
180 aa  50.4  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.486904  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1214  HoxW protein  29.87 
 
 
178 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2747  hydrogenase maturation protease  29.29 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4112  HoxW protein  27.21 
 
 
178 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111777  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0983  HoxW protein  30.26 
 
 
166 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>