More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2683 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  100 
 
 
393 aa  811  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  67.97 
 
 
407 aa  567  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  68.49 
 
 
389 aa  561  1e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  69.17 
 
 
391 aa  556  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  67.97 
 
 
388 aa  557  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  67.45 
 
 
391 aa  552  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  66.06 
 
 
391 aa  549  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  67.71 
 
 
389 aa  546  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  67.19 
 
 
389 aa  541  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  65.22 
 
 
404 aa  542  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  65.56 
 
 
396 aa  540  1e-152  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  63.35 
 
 
384 aa  530  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  61.78 
 
 
400 aa  520  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  61.98 
 
 
402 aa  518  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  62.76 
 
 
400 aa  514  1e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  63.87 
 
 
394 aa  517  1e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  62.2 
 
 
400 aa  511  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  62.5 
 
 
404 aa  513  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  63.12 
 
 
402 aa  509  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  63.42 
 
 
397 aa  504  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  9.44956e-06 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  61.14 
 
 
386 aa  502  1e-141  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  62.53 
 
 
401 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  60.05 
 
 
399 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  62.53 
 
 
401 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  59.37 
 
 
402 aa  493  1e-138  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  61.82 
 
 
400 aa  492  1e-138  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  61.52 
 
 
398 aa  490  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  61.21 
 
 
401 aa  481  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  60 
 
 
400 aa  477  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  56.12 
 
 
402 aa  455  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  57.33 
 
 
400 aa  449  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  56.77 
 
 
387 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  56.51 
 
 
388 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  60.31 
 
 
404 aa  439  1e-122  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  56.77 
 
 
387 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  56.43 
 
 
410 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  51.3 
 
 
394 aa  413  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  55 
 
 
407 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  55.58 
 
 
397 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  50.78 
 
 
388 aa  411  1e-113  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  50.26 
 
 
392 aa  406  1e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  54.33 
 
 
407 aa  407  1e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  50.52 
 
 
396 aa  407  1e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.40569e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  55.58 
 
 
404 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  50.92 
 
 
384 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  50.13 
 
 
384 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  49.12 
 
 
400 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  50.26 
 
 
394 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.84465e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  49.48 
 
 
392 aa  393  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  53.75 
 
 
392 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  48.7 
 
 
398 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.01074e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  48.18 
 
 
398 aa  385  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0403  aminotransferase class V  53.05 
 
 
378 aa  381  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  49.49 
 
 
396 aa  383  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  48.45 
 
 
398 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  48.22 
 
 
396 aa  383  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  51.72 
 
 
379 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  48.45 
 
 
398 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  49.87 
 
 
404 aa  379  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  49.61 
 
 
393 aa  380  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  47.09 
 
 
414 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  5.61511e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  48.82 
 
 
399 aa  376  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  46.48 
 
 
398 aa  374  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  47.44 
 
 
396 aa  373  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  48.44 
 
 
393 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  49.34 
 
 
390 aa  369  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  47.63 
 
 
382 aa  367  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  48.58 
 
 
394 aa  360  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  46.75 
 
 
388 aa  359  4e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  5.31678e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  46.63 
 
 
398 aa  358  7e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  46.48 
 
 
402 aa  357  1e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  6.04426e-06 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  45 
 
 
389 aa  357  2e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  48.08 
 
 
409 aa  355  5e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  44.88 
 
 
382 aa  355  9e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  45.71 
 
 
386 aa  354  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  48.67 
 
 
394 aa  351  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  45.6 
 
 
403 aa  346  5e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  45.85 
 
 
405 aa  344  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2008  aminotransferase, class V  45.14 
 
 
404 aa  343  3e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.475663  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  46.86 
 
 
388 aa  343  3e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  45.08 
 
 
417 aa  342  5e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0042  NifS family cysteine desulfurase  44.09 
 
 
396 aa  341  1e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1486  cysteine desulfurase/aminotransferase, IscS/NifS family  44.01 
 
 
392 aa  341  2e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  47.83 
 
 
395 aa  339  5e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1696  cysteine desulfurase  43.59 
 
 
396 aa  338  9e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  44.5 
 
 
403 aa  338  1e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1770  NifS family cysteine desulfurase  45.57 
 
 
396 aa  337  2e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.406981  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  45.97 
 
 
407 aa  337  2e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  50 
 
 
380 aa  337  2e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1163  NifS family cysteine desulfurase  43.85 
 
 
396 aa  335  6e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  45.71 
 
 
407 aa  335  6e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  45.45 
 
 
407 aa  335  7e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  45.79 
 
 
383 aa  335  7e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  45.71 
 
 
407 aa  335  7e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  45.27 
 
 
394 aa  335  1e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  45.45 
 
 
407 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  45.45 
 
 
407 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  44.53 
 
 
401 aa  335  1e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  45.97 
 
 
407 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0303  cysteine desulfurase  46.11 
 
 
402 aa  333  3e-90  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>