More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2629 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 788 aa  1620    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  59.27 
 
 		 1246 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 547 aa  237  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 		 1051 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  40.11 
 
 		 551 aa  222  3e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  35.22 
 
 		 549 aa  219  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 913 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 		 1093 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 681 aa  214  5.999999999999999e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 1093 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  38.71 
 
 		 783 aa  207  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  36.75 
 
 		 744 aa  204  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  39 
 
 		 488 aa  201  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  39.49 
 
 		 815 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  35.03 
 
 		 556 aa  199  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 932 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 834 aa  197  7e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 572 aa  195  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 526 aa  195  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  30.65 
 
 		 754 aa  189  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 		 3706 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 704 aa  189  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 964 aa  187  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  32.63 
 
 		 1182 aa  185  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 		 1676 aa  185  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  31.38 
 
 		 918 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 1253 aa  181  5.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 980 aa  179  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  43.18 
 
 		 909 aa  179  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  35.2 
 
 		 1239 aa  177  9e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 682 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 		 1714 aa  173  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  30.87 
 
 		 1210 aa  171  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 771 aa  171  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 		 1560 aa  170  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 524 aa  170  8e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 764 aa  169  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 878 aa  169  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 		 1044 aa  169  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 		 613 aa  168  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 		 347 aa  167  6.9999999999999995e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 		 941 aa  167  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  31.4 
 
 		 676 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 		 1177 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 872 aa  165  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 1654 aa  164  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 2693 aa  164  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  32.3 
 
 		 449 aa  164  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 839 aa  164  7e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 1051 aa  163  9e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 1390 aa  163  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 767 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 912 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 945 aa  161  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 732 aa  160  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  27.69 
 
 		 657 aa  160  9e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 644 aa  159  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5074  signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 479 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.473035 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 382 aa  159  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  43.41 
 
 		 1205 aa  158  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 991 aa  157  6e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  39.62 
 
 		 749 aa  157  9e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.13 
 
 		 765 aa  155  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  24.76 
 
 		 727 aa  154  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  40.72 
 
 		 723 aa  154  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.81 
 
 		 1131 aa  153  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 890 aa  150  8e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0271774 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  40.76 
 
 		 1668 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  40.28 
 
 		 1663 aa  149  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 892 aa  149  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 439 aa  148  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 		 1078 aa  147  6e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0316  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.51 
 
 		 764 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.889284 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2249  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.96 
 
 		 771 aa  147  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 		 924 aa  147  8.000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 631 aa  146  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 472 aa  146  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 215 aa  145  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 674 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 732 aa  144  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 746 aa  143  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  31.06 
 
 		 1248 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.83 
 
 		 758 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 		 749 aa  142  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 886 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 945 aa  140  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 1227 aa  138  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0558  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 763 aa  138  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.043921  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 782 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 790 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 752 aa  137  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 739 aa  137  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.01 
 
 		 1330 aa  137  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.72 
 
 		 1193 aa  137  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.54 
 
 		 1193 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 657 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 462 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 1047 aa  135  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 		 1611 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 492 aa  134  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>