More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2572 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2572  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 
223 aa  462  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  58.62 
 
 
211 aa  248  6e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  53.55 
 
 
211 aa  245  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0859  peptide methionine sulfoxide reductase  65.34 
 
 
183 aa  243  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0249  peptide methionine sulfoxide reductase  53.33 
 
 
214 aa  239  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294417 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  63.22 
 
 
212 aa  239  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  54.37 
 
 
212 aa  231  6e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2990  peptide methionine sulfoxide reductase  58.96 
 
 
198 aa  225  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  55.93 
 
 
260 aa  224  8e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  50.25 
 
 
368 aa  223  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  51.81 
 
 
353 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  52.13 
 
 
321 aa  218  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2651  peptide methionine sulfoxide reductase  57.89 
 
 
175 aa  218  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1188  peptide methionine sulfoxide reductase  58.48 
 
 
208 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000171924  decreased coverage  0.000921348 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0807  peptide methionine sulfoxide reductase  56.9 
 
 
174 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  51.6 
 
 
321 aa  216  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  54.29 
 
 
321 aa  216  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  51.06 
 
 
321 aa  215  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1980  peptide methionine sulfoxide reductase  55.49 
 
 
204 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  50.53 
 
 
321 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3055  peptide methionine sulfoxide reductase  56.8 
 
 
242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195694 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  50.54 
 
 
321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  51.98 
 
 
321 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  50.53 
 
 
321 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  56.29 
 
 
323 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1295  peptide methionine sulfoxide reductase  56.07 
 
 
200 aa  211  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  50 
 
 
321 aa  209  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2482  peptide methionine sulfoxide reductase  57.14 
 
 
213 aa  209  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000558183  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3441  peptide methionine sulfoxide reductase  51.52 
 
 
198 aa  209  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  50.84 
 
 
321 aa  208  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  50.84 
 
 
321 aa  208  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1885  peptide methionine sulfoxide reductase  54.71 
 
 
178 aa  205  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1443  peptide methionine sulfoxide reductase  53.53 
 
 
178 aa  205  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1931  peptide methionine sulfoxide reductase  54.12 
 
 
178 aa  205  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1688  peptide methionine sulfoxide reductase  54.12 
 
 
178 aa  204  6e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1848  peptide methionine sulfoxide reductase  54.12 
 
 
178 aa  204  7e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1964  peptide methionine sulfoxide reductase  54.71 
 
 
178 aa  204  8e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327953  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1663  peptide methionine sulfoxide reductase  54.12 
 
 
178 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.652364  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  48.86 
 
 
397 aa  203  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  52.27 
 
 
320 aa  202  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1704  peptide methionine sulfoxide reductase  53.53 
 
 
178 aa  201  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1711  peptide methionine sulfoxide reductase  53.53 
 
 
178 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1846  peptide methionine sulfoxide reductase  53.53 
 
 
178 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0104  hypothetical protein  52.84 
 
 
191 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  53.89 
 
 
328 aa  198  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0118  hypothetical protein  51.7 
 
 
191 aa  198  6e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3494  peptide methionine sulfoxide reductase  51.76 
 
 
178 aa  198  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  42.38 
 
 
416 aa  195  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  41.43 
 
 
416 aa  193  2e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1125  peptide methionine sulfoxide reductase  49.72 
 
 
201 aa  193  2e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000367889  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  39.62 
 
 
381 aa  191  7e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10418  predicted protein  51.76 
 
 
170 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.487316  normal  0.0313973 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  41.67 
 
 
380 aa  189  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  41.71 
 
 
380 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1510  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 
169 aa  184  7e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0697517  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3869  peptide methionine sulfoxide reductase  49.4 
 
 
208 aa  184  8e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.2454  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  47.4 
 
 
351 aa  184  8e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1000  methionine sulfoxide reductase A  48.85 
 
 
174 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1198  peptide methionine sulfoxide reductase  49.71 
 
 
175 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.675663  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0508  peptide methionine sulfoxide reductase  52.44 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  51.95 
 
 
185 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  43 
 
 
394 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  44.62 
 
 
225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1513  methionine sulfoxide reductase A  47.37 
 
 
177 aa  181  9.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1484  methionine sulfoxide reductase A  47.37 
 
 
177 aa  181  9.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1476  peptide methionine sulfoxide reductase  51.19 
 
 
171 aa  179  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  53.69 
 
 
155 aa  179  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2436  peptide methionine sulfoxide reductase  51.2 
 
 
198 aa  175  4e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.228717  normal  0.295225 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1450  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 
169 aa  174  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.58381  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1422  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 
169 aa  174  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2879  peptide methionine sulfoxide reductase  46.96 
 
 
223 aa  174  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.667528 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0931  methionine sulfoxide reductase A  50.97 
 
 
171 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  48.02 
 
 
183 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  43.55 
 
 
208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  52.67 
 
 
181 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2328  peptide methionine sulfoxide reductase  54.05 
 
 
153 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1645  peptide methionine sulfoxide reductase  48.78 
 
 
183 aa  172  3.9999999999999995e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2288  methionine sulfoxide reductase A  47.34 
 
 
173 aa  171  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  48.72 
 
 
186 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1538  peptide methionine sulfoxide reductase  47.16 
 
 
180 aa  170  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0351426  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1028  peptide methionine sulfoxide reductase  46.41 
 
 
196 aa  169  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384494  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1402  peptide methionine sulfoxide reductase  45.25 
 
 
197 aa  169  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  54 
 
 
180 aa  167  8e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  52.29 
 
 
197 aa  167  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  52.38 
 
 
150 aa  167  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05541  peptide methionine sulfoxide reductase  45.6 
 
 
223 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.771006 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  51.33 
 
 
181 aa  165  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 
156 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  48.3 
 
 
186 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  47.06 
 
 
180 aa  162  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  51.37 
 
 
163 aa  161  7e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2709  methionine sulfoxide reductase A  50.33 
 
 
162 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  51.7 
 
 
177 aa  160  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  46 
 
 
266 aa  160  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  49.67 
 
 
228 aa  159  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  53.42 
 
 
182 aa  159  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0559  methionine sulfoxide reductase A  40.99 
 
 
212 aa  159  4e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1883  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
159 aa  158  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.125399  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  46.41 
 
 
184 aa  159  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  44.31 
 
 
228 aa  158  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>