More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2540 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2540  protein serine/threonine phosphatases  100 
 
 
245 aa  500  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1997  protein serine/threonine phosphatase  50.21 
 
 
244 aa  209  4e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  43.16 
 
 
270 aa  186  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4678  protein serine/threonine phosphatases  41.18 
 
 
261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  39.91 
 
 
241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  37.94 
 
 
254 aa  171  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0068  serine/threonine specific protein phosphatase (putative)  41.1 
 
 
269 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3389  protein serine/threonine phosphatase  38.56 
 
 
271 aa  170  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.830216  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  37.6 
 
 
276 aa  168  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.14 
 
 
271 aa  168  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  40.5 
 
 
319 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0192  protein serine/threonine phosphatase  40.51 
 
 
268 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  40.59 
 
 
240 aa  166  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3360  protein phosphatase 2C-like  42.86 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  43.1 
 
 
416 aa  162  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.57 
 
 
261 aa  163  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  40.78 
 
 
256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  42.37 
 
 
505 aa  162  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  42.62 
 
 
519 aa  162  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  34.89 
 
 
236 aa  162  7e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  41.35 
 
 
395 aa  161  9e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  43.04 
 
 
477 aa  160  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  40.39 
 
 
256 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  40.39 
 
 
256 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  42.13 
 
 
238 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.32 
 
 
247 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  35.18 
 
 
257 aa  158  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  36.05 
 
 
259 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  36.05 
 
 
259 aa  158  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  42.13 
 
 
425 aa  158  8e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  40 
 
 
258 aa  157  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  39.39 
 
 
320 aa  157  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  40.17 
 
 
394 aa  157  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  42.26 
 
 
426 aa  156  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3622  protein serine/threonine phosphatase  37.3 
 
 
271 aa  156  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00717219  decreased coverage  0.000139718 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  42.06 
 
 
237 aa  155  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5189  protein serine/threonine phosphatase  38.84 
 
 
266 aa  155  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  38.17 
 
 
244 aa  155  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  38.4 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0770  protein serine/threonine phosphatase  38.96 
 
 
280 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0770  protein serine/threonine phosphatase  38.96 
 
 
280 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  39.04 
 
 
256 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1393  phosphoprotein phosphatase  38.3 
 
 
245 aa  154  9e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  42.13 
 
 
452 aa  154  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.1 
 
 
239 aa  153  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  39.66 
 
 
236 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  38.89 
 
 
463 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0733  serine/threonine phosphatase  39.36 
 
 
264 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.310547  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0437  protein phosphatase 2C-like  40.32 
 
 
296 aa  152  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  35.08 
 
 
267 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0866  protein serine/threonine phosphatase  37.96 
 
 
293 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.654153 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  42.55 
 
 
438 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  42.45 
 
 
241 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.16 
 
 
611 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  39.74 
 
 
449 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  41.18 
 
 
441 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  36.86 
 
 
597 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  39.47 
 
 
245 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  42.15 
 
 
255 aa  149  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  37.85 
 
 
417 aa  149  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  40.41 
 
 
241 aa  148  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  42.11 
 
 
478 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  40.34 
 
 
472 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  38.66 
 
 
250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  38.63 
 
 
538 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  36.36 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  40.43 
 
 
239 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  37.97 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  44 
 
 
516 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  40.43 
 
 
479 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  43.56 
 
 
491 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  43.56 
 
 
491 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308307  hitchhiker  0.00998453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  43.56 
 
 
491 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  35.19 
 
 
236 aa  146  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  44 
 
 
517 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  37.87 
 
 
466 aa  145  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  36.64 
 
 
234 aa  145  8.000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  35.62 
 
 
236 aa  145  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  41 
 
 
500 aa  144  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  43.11 
 
 
514 aa  144  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  35.53 
 
 
239 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  37.97 
 
 
247 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  34.6 
 
 
243 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1591  Phosphoprotein phosphatase  38.06 
 
 
253 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  40.27 
 
 
404 aa  143  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.06 
 
 
470 aa  143  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  35.86 
 
 
249 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  38.46 
 
 
449 aa  142  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  41.49 
 
 
259 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  38.3 
 
 
540 aa  142  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0590  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.85 
 
 
241 aa  142  5e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3905  protein phosphatase 2C, family protein  36.71 
 
 
250 aa  141  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3714  protein phosphatase 2C, family protein  37.13 
 
 
250 aa  141  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3604  protein phosphatase 2C  37.13 
 
 
250 aa  141  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4001  protein phosphatase 2C, family protein  37.13 
 
 
250 aa  141  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3877  protein phosphatase 2C, family protein  37.13 
 
 
250 aa  141  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.65196e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3911  protein phosphatase 2C, family protein  36.71 
 
 
250 aa  141  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00759047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  37.13 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1935  protein serine/threonine phosphatase  37.04 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.709495  hitchhiker  0.0000466361 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  39.24 
 
 
421 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>