More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2521 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  100 
 
 
235 aa  471  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  66.52 
 
 
231 aa  309  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  67.73 
 
 
230 aa  307  8e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  64.78 
 
 
229 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  65.09 
 
 
228 aa  306  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  63.91 
 
 
229 aa  304  7e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  65.32 
 
 
234 aa  301  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  65.16 
 
 
231 aa  301  7.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  65.45 
 
 
230 aa  296  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  65 
 
 
231 aa  296  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  63.04 
 
 
235 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  63.93 
 
 
229 aa  284  7e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  58.06 
 
 
235 aa  281  5.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  61.23 
 
 
268 aa  281  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0284  ABC transporter related  65 
 
 
232 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  hitchhiker  0.00000395766 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0303  ABC transporter related  65 
 
 
232 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0537962  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  61.54 
 
 
232 aa  278  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  62.1 
 
 
229 aa  278  5e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2803  ABC transporter related  64.55 
 
 
232 aa  278  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0893633  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3402  ABC efflux pump, ATPase subunit  64.55 
 
 
232 aa  278  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0029159  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0230  ABC transporter related  64.09 
 
 
232 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000298 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0222  ABC transporter related  64.09 
 
 
232 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0206  ABC transporter related  65.45 
 
 
232 aa  274  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  unclonable  0.000000000007713 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  59.91 
 
 
231 aa  272  4.0000000000000004e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1620  ABC transporter, ATPase subunit  56.96 
 
 
241 aa  261  4.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  57.21 
 
 
240 aa  255  4e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2260  ABC transporter related  54.09 
 
 
232 aa  251  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549292  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  52.51 
 
 
225 aa  248  8e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2582  ABC transporter related  54.3 
 
 
234 aa  240  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  52.29 
 
 
237 aa  238  5e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  47.96 
 
 
246 aa  225  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1802  ABC transporter related  48.87 
 
 
234 aa  223  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  47.95 
 
 
225 aa  221  9e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  48.56 
 
 
224 aa  221  9e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  48.56 
 
 
224 aa  221  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  49.09 
 
 
228 aa  220  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  47.95 
 
 
230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  47.51 
 
 
225 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  46.82 
 
 
240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 
221 aa  218  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  48.08 
 
 
224 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  47.51 
 
 
225 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  48.08 
 
 
224 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  48.08 
 
 
224 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  51.85 
 
 
236 aa  218  7e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  47.75 
 
 
252 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  50.23 
 
 
239 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  47.6 
 
 
224 aa  217  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  47.6 
 
 
224 aa  217  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  48.56 
 
 
224 aa  217  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  47.6 
 
 
224 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  47.06 
 
 
229 aa  217  1e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  46.3 
 
 
293 aa  216  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  47.6 
 
 
224 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  46.93 
 
 
240 aa  216  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2973  ABC transporter related  49.54 
 
 
222 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  46.15 
 
 
240 aa  215  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
222 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  46.85 
 
 
242 aa  214  8e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  46.4 
 
 
291 aa  214  9e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  48.87 
 
 
230 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  47.12 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  45.25 
 
 
242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  47.51 
 
 
236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  49.76 
 
 
226 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  49.08 
 
 
240 aa  212  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  45.25 
 
 
226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  49.09 
 
 
239 aa  211  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  45.98 
 
 
237 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  49.76 
 
 
226 aa  211  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  45.91 
 
 
242 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  44.64 
 
 
260 aa  211  9e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  47.69 
 
 
235 aa  211  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  46.67 
 
 
249 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  51.43 
 
 
235 aa  210  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  49.27 
 
 
226 aa  209  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  49.27 
 
 
226 aa  209  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  49.27 
 
 
226 aa  209  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  49.27 
 
 
226 aa  209  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  49.27 
 
 
226 aa  209  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  48.78 
 
 
226 aa  210  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  49.76 
 
 
226 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  45.21 
 
 
225 aa  210  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  47.71 
 
 
241 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  49.27 
 
 
226 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  49.27 
 
 
226 aa  209  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  48.65 
 
 
236 aa  209  4e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0321  ABC transporter related  49.55 
 
 
271 aa  209  4e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  45.71 
 
 
244 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  49.27 
 
 
226 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  47.09 
 
 
237 aa  209  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  46.36 
 
 
230 aa  208  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  48.18 
 
 
228 aa  208  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  45.25 
 
 
238 aa  208  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  47.77 
 
 
244 aa  208  6e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  44.75 
 
 
230 aa  208  7e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  49.31 
 
 
233 aa  207  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  49.33 
 
 
233 aa  207  8e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  50.24 
 
 
253 aa  207  8e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  44.84 
 
 
238 aa  207  9e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>