209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2468 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  100 
 
 
163 aa  334  4e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  58.68 
 
 
165 aa  205  3e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  58.13 
 
 
164 aa  197  6e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  60.12 
 
 
164 aa  193  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  59.88 
 
 
168 aa  191  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  60.12 
 
 
164 aa  191  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  57.67 
 
 
164 aa  188  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  60 
 
 
168 aa  189  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  56.52 
 
 
167 aa  187  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  1.70126e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  56.79 
 
 
168 aa  187  6e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  58.02 
 
 
168 aa  186  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  2.01822e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  59.17 
 
 
165 aa  183  1e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  3.83486e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  56.63 
 
 
165 aa  180  6e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  55.42 
 
 
165 aa  178  4e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  53.37 
 
 
166 aa  173  8e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  53.61 
 
 
166 aa  169  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  60.49 
 
 
169 aa  169  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  53.61 
 
 
166 aa  169  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.42552e-33 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  52.15 
 
 
166 aa  168  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  51.23 
 
 
172 aa  169  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  52.69 
 
 
165 aa  169  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  50.6 
 
 
166 aa  166  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  51.25 
 
 
166 aa  165  3e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  60 
 
 
163 aa  164  5e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  49.08 
 
 
166 aa  161  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  48.8 
 
 
166 aa  160  8e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  50 
 
 
165 aa  159  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  52.76 
 
 
166 aa  159  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  51.61 
 
 
158 aa  154  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  47.59 
 
 
165 aa  154  5e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  48.19 
 
 
166 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  47.59 
 
 
166 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  49.38 
 
 
164 aa  152  3e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.60498e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  47.59 
 
 
166 aa  150  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  50.92 
 
 
168 aa  150  6e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  3.46492e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  46.01 
 
 
166 aa  147  6e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  46.01 
 
 
167 aa  147  7e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  46.39 
 
 
166 aa  143  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  46.25 
 
 
167 aa  142  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  2.49666e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  43.56 
 
 
173 aa  141  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  44 
 
 
185 aa  140  1e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  44.79 
 
 
168 aa  138  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  44.58 
 
 
166 aa  138  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  45.62 
 
 
167 aa  136  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.56568e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  42.17 
 
 
166 aa  135  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  43.5 
 
 
182 aa  134  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  44.44 
 
 
170 aa  133  1e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  2.07736e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  44.07 
 
 
182 aa  133  1e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  44.44 
 
 
170 aa  133  1e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  40.91 
 
 
184 aa  132  2e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  38.95 
 
 
184 aa  131  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  42.94 
 
 
185 aa  130  7e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  41.57 
 
 
165 aa  130  8e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  42.59 
 
 
170 aa  129  1e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  43.45 
 
 
166 aa  129  1e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  43.29 
 
 
167 aa  128  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  2.23416e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  41.57 
 
 
166 aa  128  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  42.24 
 
 
169 aa  125  2e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  38.64 
 
 
184 aa  125  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  38.75 
 
 
169 aa  124  8e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  37.71 
 
 
182 aa  117  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  38.04 
 
 
166 aa  112  2e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  37.5 
 
 
184 aa  110  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  46.92 
 
 
168 aa  109  1e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  47.29 
 
 
140 aa  108  4e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  42.46 
 
 
182 aa  107  6e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  40.61 
 
 
177 aa  107  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.07911e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  43.04 
 
 
178 aa  107  7e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  47.69 
 
 
140 aa  107  9e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  48.06 
 
 
140 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  34.48 
 
 
228 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.98251e-06 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  43.04 
 
 
178 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  3.07395e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  46.92 
 
 
140 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.7438e-05 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  46.92 
 
 
140 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  46.92 
 
 
139 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  3.45358e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  46.15 
 
 
140 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  44.62 
 
 
139 aa  105  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  46.15 
 
 
140 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  46.15 
 
 
140 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  46.15 
 
 
140 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  46.15 
 
 
139 aa  105  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  46.15 
 
 
140 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  46.15 
 
 
140 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  46.15 
 
 
140 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  46.15 
 
 
140 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  46.92 
 
 
140 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  46.92 
 
 
140 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  46.92 
 
 
140 aa  105  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  46.92 
 
 
140 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  46.92 
 
 
139 aa  104  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  38.69 
 
 
392 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  46.15 
 
 
140 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  40.62 
 
 
179 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  45.38 
 
 
140 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  45.38 
 
 
139 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  6.55626e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  38.79 
 
 
178 aa  101  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.418e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  47.29 
 
 
139 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  38.79 
 
 
178 aa  99.4  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  37.58 
 
 
233 aa  98.2  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  37.22 
 
 
190 aa  97.8  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>