More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2456 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 470 aa  971    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  53.95 
 
 		 471 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  54 
 
 		 473 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  49.66 
 
 		 457 aa  456  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  27.81 
 
 		 470 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  27.62 
 
 		 380 aa  107  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  27.25 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  29.11 
 
 		 477 aa  98.2  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  27.46 
 
 		 452 aa  97.1  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  27.25 
 
 		 484 aa  95.5  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  22.17 
 
 		 439 aa  95.1  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  25.07 
 
 		 391 aa  94.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  25.07 
 
 		 391 aa  94.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 427 aa  94.4  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  27.06 
 
 		 477 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 		 499 aa  93.2  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  27.6 
 
 		 476 aa  92  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  27.04 
 
 		 402 aa  92  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 		 800 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  25.29 
 
 		 460 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  24.29 
 
 		 385 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  24.12 
 
 		 481 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  24.29 
 
 		 385 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  24.29 
 
 		 385 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  23.54 
 
 		 450 aa  91.3  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  26.93 
 
 		 453 aa  91.3  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  24.29 
 
 		 385 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  24.29 
 
 		 385 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  24.29 
 
 		 385 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  24.29 
 
 		 385 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  24.29 
 
 		 385 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003598  arylsulfatase regulator  25.56 
 
 		 440 aa  90.1  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.527576  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  22.87 
 
 		 370 aa  90.1  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  26.63 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 450 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  27.07 
 
 		 462 aa  89  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 476 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 476 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  25.14 
 
 		 476 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  29.19 
 
 		 458 aa  88.2  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 476 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  27.06 
 
 		 444 aa  87.4  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1525  protein tyrosine phosphatase  24.93 
 
 		 381 aa  86.7  9e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.469946  normal  0.164235 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.81 
 
 		 396 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  23.73 
 
 		 463 aa  86.3  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 		 344 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 		 485 aa  85.9  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.63 
 
 		 395 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.63 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  26.61 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  26.57 
 
 		 465 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  23.67 
 
 		 496 aa  85.5  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  25.87 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.56 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  24.72 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.93 
 
 		 431 aa  83.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2651  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.135076 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  23.82 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  24.93 
 
 		 383 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 435 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.93 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  25.48 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.67 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 435 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  23.86 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  27.17 
 
 		 456 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  23.86 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.93 
 
 		 431 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  25.71 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  25.71 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.87 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  23.86 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  25.54 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  24.59 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  25.49 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  25.41 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  22.43 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  25.9 
 
 		 473 aa  79.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  25.71 
 
 		 394 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  22.91 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  22.01 
 
 		 460 aa  79.7  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.36 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.93 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  26 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  23.33 
 
 		 280 aa  79  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  24.46 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1732  radical SAM domain-containing protein  23.68 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0603581  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.36 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 		 489 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  23.54 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  25.71 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  22.7 
 
 		 460 aa  77.4  0.0000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  22.13 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.99 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.238344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>