More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2433 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2433  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 578 aa  1152    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2772  sodium/hydrogen exchanger  50.95 
 
 		 571 aa  527  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  48.28 
 
 		 576 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  48.02 
 
 		 575 aa  504  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  47.25 
 
 		 592 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  47.07 
 
 		 574 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0751  sodium/hydrogen exchanger  47.45 
 
 		 581 aa  481  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0606  TrkA-N, Sodium/hydrogen exchanger  47.08 
 
 		 574 aa  475  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  31.86 
 
 		 548 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  30.12 
 
 		 566 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  29.27 
 
 		 565 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 566 aa  243  7.999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  28.4 
 
 		 566 aa  233  6e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  31.99 
 
 		 546 aa  231  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  30.09 
 
 		 558 aa  225  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3158  sodium/hydrogen exchanger  31.36 
 
 		 547 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  28.22 
 
 		 572 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2938  sodium/hydrogen exchanger  31.36 
 
 		 547 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  29.81 
 
 		 541 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0191  sodium/hydrogen exchanger  30.05 
 
 		 577 aa  219  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.912103  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  32.58 
 
 		 595 aa  217  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  30.08 
 
 		 562 aa  207  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0930  sodium/hydrogen exchanger  28.44 
 
 		 575 aa  207  6e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4337  carbonic anhydrase  28.6 
 
 		 572 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0835  sodium/hydrogen exchanger  30.2 
 
 		 561 aa  206  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  31.73 
 
 		 551 aa  203  8e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  28.99 
 
 		 720 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1614  sodium/hydrogen exchanger  28.96 
 
 		 566 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  30.45 
 
 		 663 aa  178  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  28.37 
 
 		 666 aa  178  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3972  sodium/hydrogen exchanger  32.16 
 
 		 424 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.806764  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  28.4 
 
 		 586 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  27.11 
 
 		 567 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  27.62 
 
 		 567 aa  173  9e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  28.97 
 
 		 584 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2917  sodium/hydrogen exchanger  28.09 
 
 		 561 aa  171  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.862337  hitchhiker  0.00347673 
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.59 
 
 		 567 aa  171  5e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  30.57 
 
 		 566 aa  169  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  25.68 
 
 		 682 aa  167  5e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0193  sodium/hydrogen exchanger  28.91 
 
 		 598 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4125  sodium/hydrogen exchanger  27.54 
 
 		 584 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.688995  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2098  sodium/hydrogen exchanger  28.97 
 
 		 584 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  27.42 
 
 		 665 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  27.42 
 
 		 665 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1550  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  27.48 
 
 		 582 aa  160  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00125081  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  26.53 
 
 		 585 aa  160  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  29.3 
 
 		 457 aa  159  9e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  26.96 
 
 		 775 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  26.84 
 
 		 771 aa  156  8e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  28.62 
 
 		 664 aa  156  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  26.41 
 
 		 773 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  30.67 
 
 		 662 aa  154  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  25.45 
 
 		 671 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  26.68 
 
 		 672 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  25.52 
 
 		 636 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0188  sodium/hydrogen exchanger  26.8 
 
 		 624 aa  152  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261815  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  26.23 
 
 		 649 aa  152  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  25.62 
 
 		 650 aa  152  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  25.5 
 
 		 658 aa  152  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.78 
 
 		 697 aa  151  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  27.26 
 
 		 762 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  24.86 
 
 		 666 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  28.14 
 
 		 621 aa  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0711  sodium/hydrogen exchanger  25.26 
 
 		 581 aa  150  4e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  26.96 
 
 		 665 aa  150  8e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  26.86 
 
 		 649 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  24.96 
 
 		 649 aa  148  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  26.18 
 
 		 674 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  26.88 
 
 		 656 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  26.36 
 
 		 654 aa  146  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  26.14 
 
 		 673 aa  146  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  28.15 
 
 		 657 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.21 
 
 		 620 aa  144  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  28.21 
 
 		 620 aa  144  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  28.21 
 
 		 620 aa  144  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  28.21 
 
 		 620 aa  144  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  28.21 
 
 		 620 aa  144  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  28.21 
 
 		 620 aa  143  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709743 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  28.21 
 
 		 620 aa  143  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 		 693 aa  143  9e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  28.21 
 
 		 620 aa  143  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  27.34 
 
 		 674 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  28.21 
 
 		 620 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  29.69 
 
 		 617 aa  142  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  25.34 
 
 		 648 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  24.73 
 
 		 741 aa  140  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  26.59 
 
 		 648 aa  140  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  27.35 
 
 		 660 aa  140  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1858  sodium/hydrogen exchanger  26.72 
 
 		 613 aa  140  7.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  30.82 
 
 		 586 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  25.34 
 
 		 648 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  30.73 
 
 		 586 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  24.78 
 
 		 665 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.94 
 
 		 620 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  27.45 
 
 		 684 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  25.34 
 
 		 648 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  25.13 
 
 		 670 aa  139  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  26.35 
 
 		 575 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4163  potassium efflux system protein  25.81 
 
 		 597 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0095  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.87 
 
 		 620 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>