More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2400 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 307 aa  620  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  60.61 
 
 		 307 aa  363  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  51.33 
 
 		 323 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  52.45 
 
 		 309 aa  294  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  51.69 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  48.82 
 
 		 311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  48.98 
 
 		 311 aa  279  5e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  46.82 
 
 		 328 aa  276  3e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  49.5 
 
 		 315 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  47.47 
 
 		 311 aa  264  1e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  48.94 
 
 		 285 aa  260  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  44.44 
 
 		 307 aa  238  9e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  49.29 
 
 		 285 aa  237  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  45.82 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  43.33 
 
 		 328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  47.67 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  34.46 
 
 		 314 aa  195  8.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  37.01 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  37.41 
 
 		 315 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  36.62 
 
 		 312 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  35.71 
 
 		 305 aa  169  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  36.65 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  35.23 
 
 		 320 aa  169  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  35.15 
 
 		 460 aa  169  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  36.23 
 
 		 459 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  37.71 
 
 		 481 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  33.77 
 
 		 346 aa  162  6e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  34.49 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  34.33 
 
 		 315 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  36.07 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  32.2 
 
 		 476 aa  156  4e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  35.64 
 
 		 293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  34.36 
 
 		 460 aa  155  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  35 
 
 		 293 aa  155  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  34 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  34.21 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  34.43 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  34.16 
 
 		 313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  28.81 
 
 		 331 aa  149  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  31.71 
 
 		 305 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  36.46 
 
 		 459 aa  149  5e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  31.03 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 304 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  35.13 
 
 		 302 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  34.63 
 
 		 312 aa  149  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  34.51 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  33.44 
 
 		 466 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  34.41 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  33.67 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  34.41 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  34.11 
 
 		 483 aa  145  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  34.15 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  32.3 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  30.61 
 
 		 317 aa  142  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0393  cation diffusion facilitator family transporter  36.67 
 
 		 483 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.38697 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  31.51 
 
 		 396 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  29.96 
 
 		 311 aa  139  7e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  31.03 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  30.46 
 
 		 354 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  36.6 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  32.09 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  29.86 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  32.67 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1202  cation diffusion facilitator family transporter  36.39 
 
 		 488 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0622136  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  32.97 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  35.71 
 
 		 328 aa  136  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  33.92 
 
 		 295 aa  135  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  31.1 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  30.14 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  28.86 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  28.37 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  32.42 
 
 		 295 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  30.24 
 
 		 313 aa  132  6.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  25.87 
 
 		 295 aa  132  7.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  25.87 
 
 		 295 aa  132  7.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  27.68 
 
 		 306 aa  132  9e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  25.87 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  29.21 
 
 		 317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  28.67 
 
 		 337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  32.28 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  29.97 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  31.44 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  29.12 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  29.69 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  36.58 
 
 		 478 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0253813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  26.97 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  25.81 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  30.14 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  33.09 
 
 		 301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2019  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 		 459 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1450  cation diffusion facilitator family transporter  30.98 
 
 		 460 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25137  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  34.15 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  33.08 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3095  putative cation-efflux pump  33.45 
 
 		 462 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  30.14 
 
 		 474 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1848  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 		 460 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1215  cation diffusion facilitator family transporter  34.54 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  31.32 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>