More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2390 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 348 aa  702    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  50 
 
 		 345 aa  305  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  50 
 
 		 345 aa  305  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  49.35 
 
 		 344 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  47.55 
 
 		 350 aa  290  4e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  48.06 
 
 		 359 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  49.35 
 
 		 340 aa  281  1e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  43.03 
 
 		 349 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  46.71 
 
 		 336 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  47.5 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  47.38 
 
 		 339 aa  259  7e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2157  secretion protein HlyD family protein  46.44 
 
 		 357 aa  247  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  41.36 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  41.36 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4061  secretion protein HlyD family protein  43.49 
 
 		 354 aa  238  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  42.73 
 
 		 334 aa  236  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  40.9 
 
 		 354 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  41.83 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  44.95 
 
 		 332 aa  229  8e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  46.74 
 
 		 344 aa  225  7e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  44.37 
 
 		 337 aa  222  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  44.37 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  41.42 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  39.38 
 
 		 344 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2839  secretion protein HlyD family protein  45.03 
 
 		 377 aa  216  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  41.41 
 
 		 331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  41.41 
 
 		 331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  41.41 
 
 		 331 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  41.41 
 
 		 331 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  41.41 
 
 		 331 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  40.06 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  42.76 
 
 		 347 aa  206  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1305  hypothetical protein  43.97 
 
 		 346 aa  205  8e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.126611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  40.79 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  40.79 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  40.79 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  40.79 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  40.79 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  40.79 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  40.79 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  40.79 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  40.79 
 
 		 331 aa  202  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  38.28 
 
 		 342 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  38.59 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  36.11 
 
 		 329 aa  192  8e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  39.13 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  39.61 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1020  hypothetical protein  40.12 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 328 aa  189  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  38.91 
 
 		 342 aa  188  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  35.48 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  35.67 
 
 		 281 aa  182  7e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  35.88 
 
 		 329 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  35.67 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  35.92 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  35.6 
 
 		 333 aa  177  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  31.76 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  34.58 
 
 		 355 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  29.02 
 
 		 327 aa  149  7e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  29.27 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  34.27 
 
 		 330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1607  secretion protein, HlyD family  34.24 
 
 		 331 aa  142  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  31.63 
 
 		 320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1914  multidrug ABC transporter membrane-binding protein  33.33 
 
 		 337 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178909  normal  0.404854 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  28.7 
 
 		 395 aa  137  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.02 
 
 		 500 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1291  HlyD family secretion protein  35.33 
 
 		 477 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.888104  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  30.34 
 
 		 328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.08 
 
 		 505 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  28.73 
 
 		 368 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1082  putative ABC transport system, lipoprotein  27.86 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1765  secretion protein HlyD family protein  37.02 
 
 		 541 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  32.15 
 
 		 345 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2925  secretion protein HlyD family protein  30.85 
 
 		 314 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2104  secretion protein HlyD family protein  36.46 
 
 		 541 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  26.14 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  27.3 
 
 		 331 aa  102  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  26.55 
 
 		 353 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0463  HlyD family secretion protein  29.79 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  29.71 
 
 		 517 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  26.83 
 
 		 411 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0587  hypothetical protein  28.22 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0654708  hitchhiker  0.0000117707 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  30.87 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  25.07 
 
 		 398 aa  99.8  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0402  HlyD family secretion protein  29.79 
 
 		 314 aa  99.8  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  25.92 
 
 		 427 aa  99.8  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2115  secretion protein HlyD family protein  27.76 
 
 		 334 aa  99.4  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.441068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.33 
 
 		 504 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  25.96 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4361  secretion protein HlyD family protein  28.04 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0807  secretion protein HlyD family protein  28.35 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  28.77 
 
 		 509 aa  97.8  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1263  hypothetical protein  27.34 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00237907  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  29.17 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  30.3 
 
 		 353 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1263  efflux transporter  30.58 
 
 		 415 aa  97.1  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.471028  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0696  secretion protein HlyD family protein  32.2 
 
 		 353 aa  96.3  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.24713 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.52 
 
 		 432 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  25.58 
 
 		 371 aa  95.5  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0168  secretion protein HlyD  27.78 
 
 		 356 aa  95.5  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>