More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2372 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2372  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
377 aa  763    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223606  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4646  radical SAM domain-containing protein  37.25 
 
 
371 aa  249  5e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4009  radical SAM domain-containing protein  39.42 
 
 
362 aa  232  7.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3986  radical SAM domain-containing protein  36.12 
 
 
353 aa  188  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0863511  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  30.09 
 
 
346 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0444  Radical SAM domain protein  27.95 
 
 
401 aa  116  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  29.72 
 
 
391 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2633  Radical SAM domain protein  27.58 
 
 
503 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.318786  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  30.37 
 
 
399 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  25.28 
 
 
356 aa  107  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  35.98 
 
 
380 aa  106  8e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  25.34 
 
 
358 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  25.34 
 
 
358 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  25.21 
 
 
357 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  29.43 
 
 
347 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  38.16 
 
 
394 aa  103  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 
496 aa  102  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  28.53 
 
 
380 aa  102  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  25.31 
 
 
330 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  31.73 
 
 
413 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  29.47 
 
 
428 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  37.42 
 
 
397 aa  101  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  25.94 
 
 
335 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  27.17 
 
 
366 aa  100  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  25.08 
 
 
390 aa  100  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  28.88 
 
 
395 aa  100  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  26.43 
 
 
327 aa  99.8  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  30.25 
 
 
395 aa  100  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 
330 aa  99.8  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 
330 aa  99.4  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  27.73 
 
 
334 aa  99  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 
377 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  29.79 
 
 
389 aa  99  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  24.17 
 
 
356 aa  98.6  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  26.21 
 
 
358 aa  97.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  30.64 
 
 
377 aa  98.2  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  28.66 
 
 
429 aa  97.4  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  26.38 
 
 
479 aa  97.1  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  27.44 
 
 
349 aa  96.7  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  30.67 
 
 
396 aa  96.3  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  27.67 
 
 
398 aa  96.3  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  34.15 
 
 
393 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  25.96 
 
 
333 aa  95.5  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  27.83 
 
 
561 aa  95.5  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  29.77 
 
 
367 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 
358 aa  95.9  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  32.93 
 
 
393 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  24.22 
 
 
459 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  26.71 
 
 
332 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  28 
 
 
480 aa  94.4  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  31.39 
 
 
349 aa  94.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  25.95 
 
 
359 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  28.45 
 
 
409 aa  94  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  34.87 
 
 
394 aa  94  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  24.37 
 
 
354 aa  93.6  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  29.89 
 
 
391 aa  92  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  28.42 
 
 
396 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  32.4 
 
 
405 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  31.06 
 
 
367 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  32.35 
 
 
378 aa  91.3  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  28.71 
 
 
412 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  30.45 
 
 
401 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  28.22 
 
 
393 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  30.45 
 
 
401 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  30.45 
 
 
401 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  28 
 
 
326 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  31.71 
 
 
384 aa  88.6  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  27 
 
 
415 aa  87.4  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  32.95 
 
 
429 aa  87  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  32.53 
 
 
422 aa  87.4  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  27.55 
 
 
418 aa  87  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  32.91 
 
 
399 aa  86.7  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.71 
 
 
394 aa  86.7  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  24.71 
 
 
337 aa  86.3  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  32.9 
 
 
399 aa  86.3  8e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 
342 aa  86.3  9e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  30.54 
 
 
438 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  26.91 
 
 
409 aa  85.1  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  26.29 
 
 
359 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 
422 aa  85.1  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  21.66 
 
 
491 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  25.45 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  25.73 
 
 
501 aa  84  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  30.73 
 
 
414 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  24.68 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  32.48 
 
 
397 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  28.71 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  35.29 
 
 
399 aa  83.2  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  23.91 
 
 
445 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  26.07 
 
 
391 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  30.73 
 
 
363 aa  82  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1914  Radical SAM domain protein  25.49 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  26.01 
 
 
406 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  28.39 
 
 
405 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
406 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  24.22 
 
 
410 aa  81.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.17 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  32.92 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  28.19 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  25.47 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>