More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2340 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2340  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
171 aa  347  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0726108  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2467  Redoxin domain protein  68.64 
 
 
171 aa  239  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000376738  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2959  Redoxin domain protein  64.67 
 
 
171 aa  234  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0183  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  65.66 
 
 
171 aa  229  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000056289  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2901  redoxin domain-containing protein  66.47 
 
 
169 aa  229  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000419182  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2313  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  67.08 
 
 
171 aa  227  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.262276  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4010  Redoxin domain protein  67.97 
 
 
167 aa  226  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000420392  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4103  Redoxin domain protein  67.97 
 
 
167 aa  225  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1832  redoxin domain-containing protein  66.04 
 
 
172 aa  224  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.286285  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0352  thiol peroxidase  60.48 
 
 
171 aa  215  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0867  Redoxin domain protein  59.75 
 
 
170 aa  212  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.434649 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1247  Redoxin domain protein  60.84 
 
 
173 aa  209  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00450523  normal  0.919673 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2710  Redoxin domain protein  67.32 
 
 
166 aa  209  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0729  Redoxin domain protein  66.01 
 
 
166 aa  207  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1081  Redoxin domain protein  53.33 
 
 
171 aa  200  9e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4373  thiol peroxidase  57.93 
 
 
166 aa  198  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1011  Redoxin domain protein  60.9 
 
 
167 aa  197  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0487  thiol peroxidase  57.93 
 
 
166 aa  197  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.309589 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4748  thiol peroxidase  57.32 
 
 
166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4470  redoxin domain-containing protein  57.32 
 
 
166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3312  redoxin domain-containing protein  60.78 
 
 
166 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4775  thiol peroxidase  60.13 
 
 
166 aa  193  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4537  thiol peroxidase  60.13 
 
 
166 aa  192  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.451168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4383  thiol peroxidase  60.13 
 
 
166 aa  192  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4757  thiol peroxidase  60.13 
 
 
166 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4774  thiol peroxidase  60.13 
 
 
166 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4890  thiol peroxidase  60.13 
 
 
166 aa  192  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5269  Redoxin domain protein  55.15 
 
 
232 aa  189  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1769  thiol peroxidase  56.63 
 
 
164 aa  185  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1804  thiol peroxidase  56.63 
 
 
164 aa  185  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0010  redoxin domain-containing protein  49.37 
 
 
168 aa  181  5.0000000000000004e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0754546  hitchhiker  0.00424359 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0473  Redoxin domain protein  48.75 
 
 
164 aa  179  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0408  redoxin domain-containing protein  55.35 
 
 
168 aa  178  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.989776  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1036  redoxin domain-containing protein  54.72 
 
 
168 aa  177  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1277  thiol peroxidase  51.57 
 
 
164 aa  176  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.189969  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2147  Redoxin domain protein  55.19 
 
 
165 aa  169  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0524  Redoxin domain protein  49.06 
 
 
171 aa  167  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000965772  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3579  anti-oxidant AhpCTSA family protein  48.41 
 
 
228 aa  166  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2464  anti-oxidant AhpCTSA family protein  47.02 
 
 
191 aa  160  7e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00897143  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1306  Redoxin domain protein  48.5 
 
 
170 aa  157  7e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1349  Redoxin domain protein  45.51 
 
 
197 aa  157  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0251869  hitchhiker  0.0000000000448162 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3172  redoxin domain-containing protein  45.51 
 
 
197 aa  157  8e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000900168  hitchhiker  0.000325363 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3341  anti-oxidant AhpCTSA family protein  47.5 
 
 
197 aa  156  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1204  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  46.25 
 
 
197 aa  156  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00223089  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1275  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  46.25 
 
 
197 aa  156  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000737792  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2802  redoxin domain-containing protein  46.91 
 
 
197 aa  156  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1205  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  46.25 
 
 
197 aa  156  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0888601  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3029  redoxin domain-containing protein  46.88 
 
 
197 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000167246  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3014  redoxin domain-containing protein  46.88 
 
 
197 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000289393  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1360  antioxidant Tpx  42.77 
 
 
204 aa  155  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000292969  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2676  redoxin domain-containing protein  44.58 
 
 
197 aa  154  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.055079  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2534  Redoxin domain protein  48.5 
 
 
167 aa  152  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0035  Redoxin domain protein  47.83 
 
 
168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0452  Redoxin domain protein  40.74 
 
 
166 aa  151  4e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418969  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1783  thiol peroxidase (scavengase P20)  47.02 
 
 
181 aa  149  2e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1131  thiol peroxidase  44.3 
 
 
164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1778  thiol peroxidase  46.67 
 
 
172 aa  143  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0630  thiol peroxidase  44.24 
 
 
169 aa  142  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0146681  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0997  thiol peroxidase  43.75 
 
 
164 aa  141  5e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.985452  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1193  redoxin domain-containing protein  48.47 
 
 
165 aa  140  9e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2869  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  47.85 
 
 
166 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166383  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3798  redoxin domain-containing protein  44.79 
 
 
165 aa  137  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.247869  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0642  thiol peroxidase (scavengase P20)  43.29 
 
 
175 aa  136  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1822  Redoxin domain protein  42.68 
 
 
179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1620  thiol peroxidase  44.17 
 
 
166 aa  134  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000227815  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2579  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  43.64 
 
 
166 aa  134  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0691363  normal  0.0286465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2971  thiol peroxidase  46.63 
 
 
165 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.535001  normal  0.296496 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0830  thiol peroxidase  44.17 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0211  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.17 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1903  thiol peroxidase  46.01 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1795  thiol peroxidase  46.01 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02074  Peroxiredoxin  43.98 
 
 
166 aa  131  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0091  Redoxin domain protein  47.85 
 
 
166 aa  130  6.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3068  thiol peroxidase  45.4 
 
 
166 aa  130  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0841  redoxin domain-containing protein  39.76 
 
 
199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.227128  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1240  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  44.51 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3035  thiol peroxidase  46.01 
 
 
166 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0554  Redoxin domain protein  40.57 
 
 
179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2625  thiol peroxidase  46.01 
 
 
166 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963895  normal  0.840008 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2616  thiol peroxidase  44.79 
 
 
167 aa  127  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2481  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.5 
 
 
166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0865  redoxin domain-containing protein  44.44 
 
 
167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0949069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31810  thiol peroxidase  44.79 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230308  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2783  redoxin domain-containing protein  44.51 
 
 
167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0174  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  43.29 
 
 
163 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1535  thiol peroxidase  45.18 
 
 
168 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0132  thiol peroxidase  40.74 
 
 
167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2633  redoxin domain-containing protein  43.56 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3734  redoxin  42.94 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.085288  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01301  thiol peroxidase  45.18 
 
 
168 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2322  Redoxin domain protein  45.18 
 
 
168 aa  125  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00106183  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1969  thiol peroxidase  45.18 
 
 
168 aa  125  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1439  thiol peroxidase  45.18 
 
 
168 aa  125  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1798  thiol peroxidase  45.18 
 
 
168 aa  125  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190801  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1888  thiol peroxidase  42.68 
 
 
166 aa  125  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.210029  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3430  Redoxin domain protein  44.17 
 
 
166 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0131471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0528  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  43.56 
 
 
166 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2301  thiol peroxidase  45.18 
 
 
168 aa  125  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01312  hypothetical protein  45.18 
 
 
168 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00805067  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1159  thiol peroxidase  43.9 
 
 
167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>