More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2306 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
376 aa  768    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2305  extracellular ligand-binding receptor  40.62 
 
 
380 aa  249  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  35.68 
 
 
374 aa  236  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  35.19 
 
 
376 aa  229  7e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  38.27 
 
 
402 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  37.71 
 
 
404 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  37.43 
 
 
404 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  37.15 
 
 
404 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  35.05 
 
 
386 aa  216  4e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  34.86 
 
 
419 aa  215  8e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  36.21 
 
 
384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  31.48 
 
 
398 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1429  Extracellular ligand-binding receptor  33.59 
 
 
386 aa  200  3e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0505624  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  31.94 
 
 
378 aa  200  3e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  36.94 
 
 
370 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1676  extracellular ligand-binding receptor  39.8 
 
 
370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000661006  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  33.52 
 
 
394 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  32.36 
 
 
371 aa  193  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2935  extracellular ligand-binding receptor  33.06 
 
 
386 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.412779  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  33.06 
 
 
399 aa  189  9e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2768  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  35.55 
 
 
417 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  31.09 
 
 
390 aa  186  6e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0862  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
375 aa  183  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  30.39 
 
 
392 aa  182  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  32.75 
 
 
369 aa  177  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  34.57 
 
 
382 aa  177  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  32.6 
 
 
384 aa  177  4e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3728  extracellular ligand-binding receptor  32.2 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172455  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  30.95 
 
 
390 aa  173  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  30.1 
 
 
383 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  31.42 
 
 
387 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.49 
 
 
396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1469  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 
370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000103418  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0265  extracellular ligand-binding receptor  32.18 
 
 
376 aa  162  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000854786  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  28.32 
 
 
395 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  28.2 
 
 
397 aa  160  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  29.21 
 
 
383 aa  160  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1065  Extracellular ligand-binding receptor  29.34 
 
 
381 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000196823  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3105  extracellular ligand-binding receptor  29.27 
 
 
389 aa  153  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  30.35 
 
 
387 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  29.62 
 
 
405 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1891  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.93 
 
 
395 aa  151  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.53 
 
 
388 aa  150  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  28.69 
 
 
381 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 
375 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.84 
 
 
376 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0475  Extracellular ligand-binding receptor  27.82 
 
 
372 aa  145  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000158967  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  25.19 
 
 
396 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  27.98 
 
 
391 aa  144  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3536  extracellular ligand-binding receptor  26.49 
 
 
388 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000357876  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0562  extracellular ligand-binding receptor  28.8 
 
 
385 aa  143  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.419655  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  31.91 
 
 
460 aa  142  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4469  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.71 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0610  Extracellular ligand-binding receptor  29.02 
 
 
378 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0399  branched-chain amino-acid ABC transport system periplasmic binding protein  27.61 
 
 
372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  30.79 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  30.77 
 
 
371 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1785  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.71 
 
 
371 aa  140  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1720  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.71 
 
 
371 aa  140  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  29.88 
 
 
399 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2101  Extracellular ligand-binding receptor  31.86 
 
 
380 aa  139  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  30.49 
 
 
400 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2441  putative amino acid-binding periplasmic ABC transporter protein  29.88 
 
 
336 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  30.18 
 
 
401 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  30.26 
 
 
393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6407  Extracellular ligand-binding receptor  30.88 
 
 
380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  29.57 
 
 
401 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  29.57 
 
 
401 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6456  extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 
383 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  0.286463 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.27 
 
 
399 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3145  Extracellular ligand-binding receptor  28.79 
 
 
399 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00633656  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3300  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.49 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0937  Extracellular ligand-binding receptor  29.73 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000952162  normal  0.230854 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2966  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.75 
 
 
375 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0165  outative extracellular ligand binding protein  27.75 
 
 
379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3027  putative periplasmic substrate-binding protein  27.75 
 
 
379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3416  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 
383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3344  putative periplasmic substrate-binding protein  27.75 
 
 
379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0533  Extracellular ligand-binding receptor  27.51 
 
 
393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4031  putative periplasmic substrate-binding protein  27.75 
 
 
379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1575  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.75 
 
 
379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  29.81 
 
 
376 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3957  putative periplasmic substrate-binding protein  27.75 
 
 
379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  26.78 
 
 
373 aa  134  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  29.88 
 
 
381 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6393  extracellular ligand-binding receptor  28.85 
 
 
383 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  29.25 
 
 
399 aa  133  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  29.85 
 
 
398 aa  133  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3052  extracellular ligand-binding receptor  29.91 
 
 
376 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4954  extracellular ligand-binding receptor  29.91 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.68 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5249  extracellular ligand-binding receptor  29.44 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.88 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1490  Extracellular ligand-binding receptor  29.02 
 
 
372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000299787  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0834  extracellular ligand-binding receptor  28.37 
 
 
373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5315  extracellular ligand-binding receptor  30.95 
 
 
599 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.568135 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  27.48 
 
 
397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3510  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  29.65 
 
 
371 aa  130  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533317  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  27.67 
 
 
379 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  29.57 
 
 
381 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>