More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2280 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2280  acetyl-CoA acetyltransferases  100 
 
 
426 aa  868    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0124  acetyl-CoA acetyltransferase  45.84 
 
 
402 aa  352  5e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226626  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7332  acetyl-CoA acetyltransferase  46.9 
 
 
401 aa  351  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213335  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0142  acetyl-CoA acetyltransferase  45.84 
 
 
402 aa  351  1e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.771451  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6898  acetyl-CoA acetyltransferase  47.14 
 
 
398 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0192  acetyl-CoA acetyltransferase  44.42 
 
 
402 aa  342  5e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7151  acetyl-CoA acetyltransferase  45.56 
 
 
405 aa  324  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2896  acetyl-CoA acetyltransferase  45.13 
 
 
404 aa  322  6e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1222  acetyl-CoA acetyltransferase  44.66 
 
 
404 aa  313  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0492457  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1802  acetyl-CoA acetyltransferase  45.09 
 
 
407 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1860  acetyl-CoA acetyltransferase  45.31 
 
 
402 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00028581  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  42.99 
 
 
401 aa  310  5e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  44.55 
 
 
398 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  44.55 
 
 
398 aa  301  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  42.99 
 
 
392 aa  300  4e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  42.79 
 
 
394 aa  299  6e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  44.05 
 
 
392 aa  299  7e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  42.52 
 
 
392 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  39.67 
 
 
392 aa  297  3e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  42.32 
 
 
393 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  41.53 
 
 
403 aa  296  6e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  42.08 
 
 
393 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  42.32 
 
 
392 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  39.95 
 
 
392 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  42.08 
 
 
392 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  43.47 
 
 
395 aa  293  3e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2726  acetyl-CoA acetyltransferase  42.45 
 
 
404 aa  293  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  42.08 
 
 
392 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4150  acetyl-CoA acetyltransferase  41.47 
 
 
391 aa  293  5e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0127373  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2498  acetyl-CoA acetyltransferase  40.57 
 
 
389 aa  292  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1109  acetyl-CoA acetyltransferase  41.23 
 
 
391 aa  291  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228356  normal  0.198631 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4076  acetyl-CoA acetyltransferase  41.23 
 
 
391 aa  290  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0498749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3932  acetyl-CoA acetyltransferase  41.23 
 
 
391 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.650395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3765  acetyl-CoA acetyltransferase  41.23 
 
 
391 aa  290  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  40.95 
 
 
393 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4240  acetyl-CoA acetyltransferase  41.23 
 
 
391 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4043  acetyl-CoA acetyltransferase  41.23 
 
 
391 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3852  acetyl-CoA acetyltransferase  41.23 
 
 
391 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647198  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  41.61 
 
 
392 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4129  acetyl-CoA acetyltransferase  41.23 
 
 
391 aa  290  4e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2722  acetyl-CoA acetyltransferase  40.28 
 
 
391 aa  289  6e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3780  acetyl-CoA acetyltransferase  41 
 
 
391 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514238  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  40.52 
 
 
393 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1491  acetyl-CoA acetyltransferase  38.89 
 
 
393 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1976  acetyl-CoA acetyltransferase  42.86 
 
 
405 aa  286  4e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1758  acetyl-CoA acetyltransferase  42 
 
 
404 aa  286  7e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1805  acetyl-CoA acetyltransferase  42 
 
 
404 aa  286  7e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  40.05 
 
 
393 aa  285  8e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  41.22 
 
 
399 aa  285  9e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  40.66 
 
 
392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2284  acetyl-CoA acetyltransferase  40.71 
 
 
392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3929  acetyl-CoA acetyltransferase  44.34 
 
 
403 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.041846 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2857  acetyl-CoA acetyltransferase  43.23 
 
 
392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  39.72 
 
 
396 aa  283  4.0000000000000003e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3827  acetyl-CoA acetyltransferase  42.89 
 
 
403 aa  282  7.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241233  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  40.43 
 
 
392 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  43.13 
 
 
395 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1739  acetyl-CoA acetyltransferase  41.53 
 
 
404 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126801  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  39.72 
 
 
396 aa  281  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3344  acetyl-CoA acetyltransferase  40.33 
 
 
392 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0618953  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4612  acetyl-CoA acetyltransferase  40.48 
 
 
392 aa  281  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000000000297368  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  41.57 
 
 
393 aa  280  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0225  acetyl-CoA acetyltransferase  41.47 
 
 
395 aa  279  7e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  42.48 
 
 
396 aa  278  9e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3251  acetyl-CoA acetyltransferase  40.62 
 
 
392 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00372711 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3171  acetyl-CoA acetyltransferase  40.62 
 
 
392 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3237  acetyl-CoA acetyltransferase  40.62 
 
 
392 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000800068 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3352  acetyl-CoA acetyltransferase  40.62 
 
 
402 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.378933 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0363  acetyl-CoA acetyltransferase  41 
 
 
394 aa  277  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0412  acetyl-CoA acetyltransferase  38.5 
 
 
393 aa  276  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0402  acetyl-CoA acetyltransferase  38.5 
 
 
393 aa  276  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3188  acetyl-CoA acetyltransferase  40.62 
 
 
392 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4368  acetyl-CoA acetyltransferase  41.71 
 
 
405 aa  276  4e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1441  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  40.24 
 
 
393 aa  276  5e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0922147 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3299  acetyl-CoA acetyltransferase  41.57 
 
 
392 aa  276  6e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  41.61 
 
 
424 aa  276  7e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  41.57 
 
 
393 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  41.57 
 
 
393 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  41.57 
 
 
393 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  41.57 
 
 
393 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2074  acetyl-CoA acetyltransferase  41.37 
 
 
393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  41.33 
 
 
393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  41.57 
 
 
393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  41.57 
 
 
393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  40.38 
 
 
393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  41.33 
 
 
393 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1260  acetyl-CoA acetyltransferase  41.09 
 
 
393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  42.42 
 
 
393 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  41.81 
 
 
393 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1875  acetyl-CoA acetyltransferase  40.95 
 
 
391 aa  274  3e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  41.09 
 
 
390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  41.13 
 
 
392 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1134  acetyl-CoA acetyltransferase  39.24 
 
 
398 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  42.62 
 
 
394 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  41.09 
 
 
394 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3545  acetyl-CoA acetyltransferase  41.19 
 
 
393 aa  272  9e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  41.37 
 
 
393 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0636  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  39.34 
 
 
389 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  39.06 
 
 
393 aa  271  1e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2478  acetyl-CoA acetyltransferase  43.84 
 
 
393 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>