More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2195 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  100 
 
 
168 aa  339  8e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2028  NLP/P60 protein  42.61 
 
 
233 aa  137  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0199  NLP/P60 protein  46.25 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  46.84 
 
 
173 aa  124  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  39.43 
 
 
215 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0992  hypothetical protein  51.11 
 
 
170 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.480266  normal  0.532227 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  46.72 
 
 
224 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  49.6 
 
 
194 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  47.66 
 
 
220 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  39.29 
 
 
215 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  49.25 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  46.83 
 
 
192 aa  117  9e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  38.65 
 
 
248 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  46.72 
 
 
223 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  44.44 
 
 
228 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  45.08 
 
 
234 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  46.72 
 
 
223 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  45.9 
 
 
223 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  46.72 
 
 
223 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  45.9 
 
 
223 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  45.83 
 
 
218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  36.96 
 
 
382 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  45 
 
 
258 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  45.83 
 
 
218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  45.83 
 
 
218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  45.83 
 
 
234 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  45.83 
 
 
234 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  46.67 
 
 
224 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  50.39 
 
 
209 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  45.83 
 
 
234 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  45.08 
 
 
221 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  44.93 
 
 
242 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  45.83 
 
 
218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0021  NLP/P60 protein  46.48 
 
 
165 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  37.14 
 
 
222 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  50.39 
 
 
209 aa  115  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  46.15 
 
 
285 aa  115  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  45.08 
 
 
223 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  49.61 
 
 
303 aa  115  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  45.16 
 
 
226 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  36.72 
 
 
363 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  36.72 
 
 
363 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  36.72 
 
 
363 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  49.15 
 
 
192 aa  114  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  44.54 
 
 
404 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  37.36 
 
 
354 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  43.09 
 
 
369 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  44.53 
 
 
183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  44.54 
 
 
418 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  45 
 
 
221 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  45.83 
 
 
202 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  36.78 
 
 
353 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  44.07 
 
 
230 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  36 
 
 
364 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  45 
 
 
212 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  43.94 
 
 
208 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  45.83 
 
 
226 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  41.01 
 
 
205 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  45.93 
 
 
211 aa  112  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  42.95 
 
 
333 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  42.96 
 
 
207 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  36.11 
 
 
407 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  36.11 
 
 
404 aa  111  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  42.96 
 
 
208 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  36.11 
 
 
404 aa  111  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  36.11 
 
 
407 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  36.11 
 
 
407 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  36.11 
 
 
407 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  36.11 
 
 
407 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  42.96 
 
 
208 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  46.61 
 
 
210 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  43.7 
 
 
407 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  44.72 
 
 
170 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  47.9 
 
 
274 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  45.38 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  41.5 
 
 
198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  41.22 
 
 
177 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  43.33 
 
 
249 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  43.61 
 
 
201 aa  108  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  44.92 
 
 
265 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  41.26 
 
 
181 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  46.34 
 
 
177 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  41.03 
 
 
177 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  38.73 
 
 
181 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  46.34 
 
 
177 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  45.97 
 
 
197 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  42.96 
 
 
187 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0001  NLP/P60 protein  40.91 
 
 
160 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309085  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0019  NLP/P60 protein  40.26 
 
 
160 aa  105  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0865382  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  44.09 
 
 
391 aa  105  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  42.15 
 
 
169 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  45.9 
 
 
177 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  49.14 
 
 
273 aa  104  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  40.3 
 
 
188 aa  104  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  45.08 
 
 
178 aa  104  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  41.94 
 
 
458 aa  103  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  47.93 
 
 
225 aa  103  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0741  NLP/P60  37.42 
 
 
167 aa  103  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  47.06 
 
 
257 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  45.9 
 
 
177 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>