More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2133 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2133  ABC transporter related  100 
 
 		 256 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1712  ABC transporter related  43.36 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  38.67 
 
 		 418 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  41.63 
 
 		 536 aa  198  6e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  41.77 
 
 		 490 aa  196  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0556  ABC transporter related  38.67 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  41.05 
 
 		 405 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1315  ABC transporter related  41.73 
 
 		 267 aa  186  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  38.67 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3105  ATPase  42.91 
 
 		 275 aa  185  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  40.83 
 
 		 409 aa  185  6e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  40.61 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  36.86 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  39.36 
 
 		 424 aa  183  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  38.04 
 
 		 455 aa  182  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2312  ABC transporter related  42.19 
 
 		 271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14339 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  42.19 
 
 		 419 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1498  ABC transporter related  46.12 
 
 		 337 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  38.62 
 
 		 424 aa  181  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0562  ABC transporter related  36.1 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0797  ABC transporter related  44.3 
 
 		 318 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.08 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  40.25 
 
 		 414 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  40.33 
 
 		 494 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  35.09 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  37.34 
 
 		 268 aa  175  6e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0511  ABC transporter related  39.59 
 
 		 259 aa  175  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  35.89 
 
 		 251 aa  174  9e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0846  ABC transporter related  36.21 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  40.34 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0869  ABC transporter related  36.21 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  34.34 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  37.61 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.08 
 
 		 271 aa  172  5.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3549  ABC transporter-related protein  43.75 
 
 		 271 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0341647  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3466  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 		 269 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39496  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  37.08 
 
 		 271 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  37.08 
 
 		 271 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.08 
 
 		 271 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  37.08 
 
 		 271 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.08 
 
 		 271 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.08 
 
 		 271 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.73 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0686  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.92 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.926109 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.08 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1512  ABC transporter-related protein  35.54 
 
 		 419 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  38.1 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0748  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.92 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.08 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0629  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.92 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.781197  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0643  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.92 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3617  ABC transporter related  43.75 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  36.71 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  38.46 
 
 		 490 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  38.94 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1135  ATPase  40.49 
 
 		 421 aa  170  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.374033  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1071  ABC transporter related  39.43 
 
 		 427 aa  170  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1803  ABC transporter related  40.27 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  41.8 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  42.47 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0702  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0214  ferrichrome ABC transporter  31.91 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  36.18 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1079  ATPase  37.45 
 
 		 421 aa  169  5e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1141  ABC transporter related  35.51 
 
 		 303 aa  168  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01766  hypothetical protein  36.25 
 
 		 267 aa  168  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0495  ABC transporter related  40.08 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0931596  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1432  ABC transporter related  34.38 
 
 		 260 aa  168  8e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2062  ABC transporter-related protein  35.95 
 
 		 266 aa  168  9e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277516  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  37.18 
 
 		 268 aa  168  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2232  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.4 
 
 		 259 aa  168  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  36.25 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  42.36 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0215  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  31.91 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2406  ABC transporter-related protein  35.59 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  36.25 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  41.92 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  33.62 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  38.02 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1122  ABC transporter related  37.3 
 
 		 427 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.672598  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  34 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  35.34 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37300  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39.26 
 
 		 290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  36.86 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2125  ABC transporter related  36.44 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179374  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  37.87 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4658  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.25 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  38.49 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  38.7 
 
 		 266 aa  165  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  40 
 
 		 384 aa  165  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.84 
 
 		 273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  39.06 
 
 		 264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4439  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.84 
 
 		 256 aa  165  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2860  ABC transporter related  38.15 
 
 		 255 aa  165  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.019123  normal  0.0516236 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4784  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.84 
 
 		 256 aa  165  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  40.17 
 
 		 266 aa  165  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  40.17 
 
 		 266 aa  165  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  40.17 
 
 		 266 aa  165  8e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>