More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2098 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
295 aa  598  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  45.85 
 
 
275 aa  203  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 
299 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  37.3 
 
 
261 aa  169  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.3 
 
 
260 aa  166  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  59.35 
 
 
138 aa  146  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  53.6 
 
 
129 aa  142  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  50.39 
 
 
133 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  51.09 
 
 
152 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.39 
 
 
132 aa  136  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  54.24 
 
 
131 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  48.76 
 
 
134 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.9 
 
 
125 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50.83 
 
 
132 aa  126  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  47.9 
 
 
125 aa  127  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  48.36 
 
 
130 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  44.26 
 
 
128 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  51.72 
 
 
138 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  58.59 
 
 
123 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  44.17 
 
 
128 aa  123  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  47.5 
 
 
132 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  47.5 
 
 
132 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  47.5 
 
 
132 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  47.5 
 
 
132 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  44.17 
 
 
128 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  44.17 
 
 
128 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  44.17 
 
 
128 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  44.17 
 
 
128 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 
259 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  57.73 
 
 
110 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.67 
 
 
132 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  47.06 
 
 
148 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.67 
 
 
132 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.67 
 
 
132 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  56 
 
 
109 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  57.73 
 
 
118 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  30.53 
 
 
256 aa  119  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  45.45 
 
 
152 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0944  carboxymuconolactone decarboxylase  52.85 
 
 
132 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292875  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  42.98 
 
 
150 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1753  carboxymuconolactone decarboxylase  50.83 
 
 
144 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.165068 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1781  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
144 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1867  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
144 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159406  hitchhiker  0.000781215 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6236  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
144 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1843  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
144 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.19287  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.7 
 
 
248 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5144  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
144 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0349025  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1430  carboxymuconolactone decarboxylase  49.17 
 
 
145 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.5 
 
 
136 aa  102  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0768  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.38 
 
 
250 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000904176 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6219  carboxymuconolactone decarboxylase  27.03 
 
 
363 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  37.82 
 
 
122 aa  98.6  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2511  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.65 
 
 
281 aa  98.6  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  26.18 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0521  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.68 
 
 
127 aa  95.9  7e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 
396 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.43 
 
 
398 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  26.86 
 
 
239 aa  92  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3910  carboxymuconolactone decarboxylase  26.01 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.984224  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6060  carboxymuconolactone decarboxylase  23.48 
 
 
283 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5696  carboxymuconolactone decarboxylase  23.48 
 
 
283 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  35.04 
 
 
380 aa  87.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  25.66 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3089  carboxymuconolactone decarboxylase  24.79 
 
 
265 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0170  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.5 
 
 
257 aa  82  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4713  carboxymuconolactone decarboxylase  25.86 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.48 
 
 
129 aa  80.1  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1188  carboxymuconolactone decarboxylase  42.11 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.373506  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  36.36 
 
 
129 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  35.54 
 
 
129 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  35.54 
 
 
129 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  32.14 
 
 
132 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.77 
 
 
123 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
128 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4461  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.45 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.273934 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  38.38 
 
 
268 aa  72  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
132 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  28.91 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  35.54 
 
 
129 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  34.78 
 
 
125 aa  72  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  29.1 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.971956  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3140  hypothetical protein  29.65 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  42.35 
 
 
129 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  33.02 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.71 
 
 
125 aa  71.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.52 
 
 
130 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3905  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.24 
 
 
131 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00819268  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.52 
 
 
130 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0952  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.29 
 
 
127 aa  70.5  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.52 
 
 
130 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4019  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.24 
 
 
131 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000710611  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2931  carboxymuconolactone decarboxylase  30.16 
 
 
129 aa  70.1  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000640912  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2482  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.13 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156087  normal  0.0594202 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2194  carboxymuconolactone decarboxylase  39.13 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  33.09 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2086  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.13 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000641307  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3793  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.54 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0130032  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2032  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.92 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  35.48 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  33.06 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>