More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2087 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 86 aa  162  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 87 aa  88.6  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 87 aa  84.3  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 87 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2436  ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  51.19 
 
 		 87 aa  80.1  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 87 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  51.76 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0994  30S ribosomal protein S20  52.5 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.945897  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 88 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 89 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3031  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.362644  normal  0.541677 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  48.84 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0016  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 87 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0741  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1718  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2297  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1783  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 85 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1598  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2044  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  41.86 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1965  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 84 aa  67  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4212  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 88 aa  67  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1806  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 89 aa  67  0.00000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0293621  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0075  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1619  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0001  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7677  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118438  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0001  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  65.1  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4890  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.540354  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  44.19 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0001  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3131  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768382  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4943  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1384  ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  45.24 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4712  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822452  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0001  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00020529  normal  0.124488 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  47.95 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3274  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 86 aa  63.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4421  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0819  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>