More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2076 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  100 
 
 		 202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  36.67 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  33.81 
 
 		 214 aa  115  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  33.53 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  34.88 
 
 		 210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  36.63 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  31.86 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  33.9 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  35.23 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  32.95 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  30.64 
 
 		 221 aa  101  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  30.66 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  30.43 
 
 		 214 aa  99.8  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  34.8 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  31.12 
 
 		 219 aa  98.2  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  38.13 
 
 		 154 aa  96.7  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  30.64 
 
 		 230 aa  96.3  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  39.69 
 
 		 162 aa  95.9  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  32.67 
 
 		 232 aa  95.5  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  35.14 
 
 		 209 aa  95.1  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  39.69 
 
 		 162 aa  94.7  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  34.68 
 
 		 227 aa  92.8  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  27.18 
 
 		 224 aa  92.4  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  32.86 
 
 		 216 aa  92.4  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  29.52 
 
 		 214 aa  91.3  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  29.7 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  31.21 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  26.54 
 
 		 217 aa  89.4  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  24.64 
 
 		 214 aa  89  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  24.64 
 
 		 214 aa  89  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  24.64 
 
 		 214 aa  89  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  24.64 
 
 		 214 aa  88.6  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  24.64 
 
 		 214 aa  88.6  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  25.12 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  24.64 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  24.64 
 
 		 214 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  24.64 
 
 		 214 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  24.64 
 
 		 214 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  34.85 
 
 		 145 aa  87.4  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  29.91 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  31.46 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  29.29 
 
 		 220 aa  87  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  24.15 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  28.17 
 
 		 221 aa  85.5  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  29.91 
 
 		 215 aa  84.7  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  35.37 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  28.64 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  32.29 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  38.89 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  29.35 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  29.67 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  36.11 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  38.4 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  30.56 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0178  CBS domain-containing protein  33.83 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  37.82 
 
 		 875 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  36.3 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  36.3 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  25.23 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2010  CBS domain-containing protein  34.38 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.348735  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  32.28 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  33.86 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  32.33 
 
 		 143 aa  72  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  29.63 
 
 		 142 aa  72  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2351  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 		 283 aa  71.2  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000984272  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  26.24 
 
 		 222 aa  71.2  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  36.75 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  32.31 
 
 		 138 aa  70.9  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  35 
 
 		 142 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  36.36 
 
 		 640 aa  69.7  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  32.41 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  31.37 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1068  CBS domain-containing protein  30 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  34.71 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  31.58 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  33.05 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  32.84 
 
 		 143 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  32.84 
 
 		 143 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  35 
 
 		 769 aa  67.4  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  32.84 
 
 		 143 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3952  signal transduction protein  27.59 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  32.84 
 
 		 143 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1556  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.09 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  28.57 
 
 		 142 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 133 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  31.93 
 
 		 148 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  34.68 
 
 		 146 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  36.28 
 
 		 897 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  34.68 
 
 		 146 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  34.33 
 
 		 249 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  31.67 
 
 		 132 aa  67  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  32.77 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  34.68 
 
 		 146 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  33.33 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  34.4 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  34.51 
 
 		 859 aa  65.5  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1059  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  30 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>