212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2044 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  100 
 
 		 143 aa  284  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4948  Peptidoglycan-binding LysM  49.67 
 
 		 153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4170  peptidoglycan-binding LysM  42.94 
 
 		 163 aa  120  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301843  normal  0.177746 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02521  hypothetical protein  41.89 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1018  Peptidoglycan-binding LysM  41.89 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1041  LysM domain/BON superfamily protein  41.89 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2800  LysM domain/BON superfamily protein  41.89 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2945  LysM domain/BON superfamily protein  41.89 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3907  LysM domain/BON superfamily protein  41.89 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.979345  normal  0.391605 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02485  hypothetical protein  41.89 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3216  LysM domain/BON superfamily protein  41.89 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0533  peptidoglycan-binding LysM  42.77 
 
 		 162 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235675  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2785  LysM domain/BON superfamily protein  41.89 
 
 		 149 aa  113  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.267708 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2836  LysM domain/BON superfamily protein  44.59 
 
 		 148 aa  113  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0549  Peptidoglycan-binding LysM  42.77 
 
 		 162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1393  LysM domain/BON superfamily protein  43.59 
 
 		 156 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3097  LysM domain/BON superfamily protein  41.89 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2908  LysM domain/BON superfamily protein  41.89 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2940  LysM domain/BON superfamily protein  41.89 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.137331 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2992  LysM domain/BON superfamily protein  41.89 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.021376 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1818  LysM domain/BON superfamily protein  42.95 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2975  LysM domain/BON superfamily protein  41.89 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.870465  normal  0.0673181 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1904  LysM domain/BON superfamily protein  42.95 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5181  LysM domain/BON superfamily protein  42.95 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.556952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2667  LysM domain/BON superfamily protein  41.77 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000146101  normal  0.333538 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6198  LysM domain/BON superfamily protein  42.95 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0206564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1881  LysM domain/BON superfamily protein  42.95 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168616  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1790  LysM domain/BON superfamily protein  42.95 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1297  transport-associated protein  41.94 
 
 		 156 aa  110  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451371  normal  0.073309 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68400  LysM domain/BON superfamily protein  46.94 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00863438  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5404  LysM domain protein  42.07 
 
 		 146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5918  LysM domain/BON superfamily protein  46.26 
 
 		 145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0283  LysM domain/BON superfamily protein  42.07 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0258  LysM domain/BON superfamily protein  41.38 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0155386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0273  LysM domain/BON superfamily protein  41.38 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4952  LysM domain/BON superfamily protein  41.38 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182933  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2004  LysM domain/BON superfamily protein  35.85 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  43.59 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4943  LysM domain/BON superfamily protein  42.07 
 
 		 146 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0282  LysM domain/BON superfamily protein  41.38 
 
 		 146 aa  100  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  36.25 
 
 		 161 aa  100  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  36.25 
 
 		 161 aa  100  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2148  LysM domain/BON superfamily protein  36.42 
 
 		 160 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00099645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  35.58 
 
 		 166 aa  94.7  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0662  putative cell wall turnover protein  35.76 
 
 		 185 aa  93.6  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1755  peptidoglycan-binding LysM  35.76 
 
 		 195 aa  92.8  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.273127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0302  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  36.13 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0917  LysM domain/BON superfamily protein  34.52 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0952  LysM domain/BON superfamily protein  34.13 
 
 		 167 aa  87  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954636  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0523  LysM domain/BON superfamily protein  33.33 
 
 		 168 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000072506  hitchhiker  0.00844539 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0518  LysM domain/BON superfamily protein  32.74 
 
 		 168 aa  84.7  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000100124  decreased coverage  0.00200043 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0459  LysM domain/BON superfamily protein  31.55 
 
 		 168 aa  84  7e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2006  Peptidoglycan-binding LysM  32.89 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899391  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2427  LysM domain/BON superfamily protein  35.48 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2264  LysM domain/BON superfamily protein  35.48 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2304  LysM domain/BON superfamily protein  35.48 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2167  LysM domain/BON superfamily protein  34.84 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.420767  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2273  Peptidoglycan-binding LysM  54.69 
 
 		 546 aa  71.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000673972  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  58.82 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3255  LysM domain/BON superfamily protein  32.24 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  54.9 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2795  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  40.71 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683971  normal  0.0904413 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2152  Peptidoglycan-binding LysM  52.17 
 
 		 334 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0285  peptidoglycan-binding LysM  48.98 
 
 		 1095 aa  53.9  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 242 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0326  LysM domain protein  44.44 
 
 		 377 aa  52  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0219877  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3954  hypothetical protein  40.35 
 
 		 405 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  43.18 
 
 		 390 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3357  Peptidoglycan-binding LysM  43.18 
 
 		 364 aa  50.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1358  peptidoglycan-binding LysM  47.06 
 
 		 230 aa  50.8  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000598649  hitchhiker  5.9516e-20 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  43.18 
 
 		 395 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2228  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 319 aa  51.2  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00208524  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2688  peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 		 361 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00047104  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0979  peptidoglycan-binding LysM  44.62 
 
 		 651 aa  50.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4083  peptidoglycan-binding LysM  43.75 
 
 		 420 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2328  peptidoglycan-binding LysM  34.72 
 
 		 234 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000346433  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0448  LysM domain-containing protein  38.27 
 
 		 404 aa  50.4  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0441  LysM domain-containing protein  38.27 
 
 		 404 aa  50.4  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21565  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3268  Peptidoglycan-binding LysM  40.74 
 
 		 339 aa  50.1  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000361142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1464  LysM domain-containing protein  42.31 
 
 		 229 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.026138  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  43.18 
 
 		 388 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1112  peptidoglycan-binding LysM  47.92 
 
 		 322 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0019  Peptidoglycan-binding LysM  41.67 
 
 		 349 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0018  LysM domain protein  41.67 
 
 		 349 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  43.14 
 
 		 212 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3426  Peptidoglycan-binding LysM  37.97 
 
 		 1091 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  41.67 
 
 		 234 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0188  peptidoglycan-binding LysM  44.44 
 
 		 350 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749903 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  48.98 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0991  peptidoglycan-binding LysM  43.75 
 
 		 339 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0156975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0530  peptidoglycan-binding LysM  32.79 
 
 		 331 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1891  Lytic transglycosylase catalytic  39.29 
 
 		 304 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0553  peptidoglycan-binding LysM  41.67 
 
 		 428 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0582  Peptidoglycan-binding LysM  46.94 
 
 		 193 aa  48.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.628153  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0972  peptidoglycan-binding LysM  36.07 
 
 		 546 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  48.28 
 
 		 954 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1487  peptidoglycan-binding LysM  36 
 
 		 425 aa  48.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1331  CHAP domain-containing protein  42.59 
 
 		 372 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.745429  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4963  peptidoglycan-binding LysM  33.78 
 
 		 380 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867782  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1306  CHAP domain-containing protein  42.59 
 
 		 372 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.387302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>