More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2001 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  625  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  33.44 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.37 
 
 		 309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.14 
 
 		 310 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  27.27 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  30.72 
 
 		 294 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.95 
 
 		 309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.39 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.49 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  30.41 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  29.33 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  31.44 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  31.14 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.27 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  26.8 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.87 
 
 		 314 aa  102  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 		 295 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  30.71 
 
 		 315 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  30.71 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  24.58 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  30.71 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  30.71 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4044  carboxylate/amino acid/amine transporter  31.27 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0378511 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.95 
 
 		 323 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  27.9 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  27.81 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  27.3 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  25.08 
 
 		 308 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0492  DMT family permease  24.08 
 
 		 308 aa  99.4  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.348836  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  26.33 
 
 		 321 aa  99  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.33 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0550  EamA family protein  24.08 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0581  eama family protein  24.08 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  24.75 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1774  transporter, EamA family  26.96 
 
 		 321 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.33 
 
 		 308 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  27.67 
 
 		 300 aa  96.3  6e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.18 
 
 		 308 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0637  transporter, EamA family  23.75 
 
 		 308 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.31 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1583  drug/metabolite exporter family protein  26.96 
 
 		 322 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0220405  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.96 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  29.27 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.96 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  28.96 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.96 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1809  transporter, EamA family  26.96 
 
 		 322 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1631  EamA family protein  26.96 
 
 		 322 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00303775  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.96 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.96 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  27.62 
 
 		 322 aa  93.6  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  28.96 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1759  eama family protein  26.96 
 
 		 322 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0623862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1609  drug/metabolite exporter family protein  26.96 
 
 		 322 aa  93.2  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313056  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1777  transporter  27.3 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.96 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.96 
 
 		 307 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  24.34 
 
 		 308 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000007978  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0033  carboxylate/amino acid/amine transporter  27.3 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.777153  normal  0.606163 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  28.92 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  27.09 
 
 		 304 aa  91.7  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  26.81 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0979  DMT family permease  25.41 
 
 		 299 aa  90.9  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.974492  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0947  integral membrane protein  27.4 
 
 		 290 aa  90.1  4e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114087  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0438  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.98 
 
 		 316 aa  90.5  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 289 aa  90.5  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  26.55 
 
 		 315 aa  90.1  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2244  DMT family permease  28.21 
 
 		 297 aa  90.1  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.705911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  25.17 
 
 		 309 aa  89.7  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.43 
 
 		 310 aa  89.4  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  31.14 
 
 		 294 aa  89  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.42 
 
 		 316 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0876  integral membrane protein  26.71 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00907858  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0919  hypothetical protein  27.27 
 
 		 305 aa  86.7  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  28.92 
 
 		 309 aa  85.9  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  29.41 
 
 		 289 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  25.24 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.44 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0742  hypothetical protein  26.54 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0911  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.53 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168694  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.03 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.62 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  28.57 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1617  transporter  27.99 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  28.22 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0320  hypothetical protein  24.76 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  23.08 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  28.22 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.05 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  27.8 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  25 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0474  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.9 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  25.77 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.15 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0634  DMT family permease  26.28 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.190735  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  29.93 
 
 		 351 aa  79  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.27 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  24.91 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>